Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRZ8

Tspo2, Translocator protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspo2Q9CRZ8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspo2Q9CRZ8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspo2Q9CRZ8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspo2Q9CRZ8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspo2Q9CRZ8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspo2Q9CRZ8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspo2Q9CRZ8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspo2Q9CRZ8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspo2Q9CRZ8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspo2Q9CRZ8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspo2Q9CRZ8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspo2Q9CRZ8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspo2Q9CRZ8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspo2Q9CRZ8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspo2Q9CRZ8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspo2Q9CRZ8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspo2Q9CRZ8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspo2Q9CRZ8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspo2Q9CRZ8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspo2Q9CRZ8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspo2Q9CRZ8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspo2Q9CRZ8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspo2Q9CRZ8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspo2Q9CRZ8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspo2Q9CRZ8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspo2Q9CRZ8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspo2Q9CRZ8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspo2Q9CRZ8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspo2Q9CRZ8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tspo2Q9CRZ8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tspo2Q9CRZ8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Tspo2Q9CRZ8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspo2Q9CRZ8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspo2Q9CRZ8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspo2Q9CRZ8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspo2Q9CRZ8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspo2Q9CRZ8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspo2Q9CRZ8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspo2Q9CRZ8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspo2Q9CRZ8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspo2Q9CRZ8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspo2Q9CRZ8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspo2Q9CRZ8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspo2Q9CRZ8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspo2Q9CRZ8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspo2Q9CRZ8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspo2Q9CRZ8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspo2Q9CRZ8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspo2Q9CRZ8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspo2Q9CRZ8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspo2Q9CRZ8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspo2Q9CRZ8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspo2Q9CRZ8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspo2Q9CRZ8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspo2Q9CRZ8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspo2Q9CRZ8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspo2Q9CRZ8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspo2Q9CRZ8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspo2Q9CRZ8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspo2Q9CRZ8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspo2Q9CRZ8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspo2Q9CRZ8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspo2Q9CRZ8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspo2Q9CRZ8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspo2Q9CRZ8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspo2Q9CRZ8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspo2Q9CRZ8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspo2Q9CRZ8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspo2Q9CRZ8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspo2Q9CRZ8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspo2Q9CRZ8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspo2Q9CRZ8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspo2Q9CRZ8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspo2Q9CRZ8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspo2Q9CRZ8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspo2Q9CRZ8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspo2Q9CRZ8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspo2Q9CRZ8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspo2Q9CRZ8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tspo2Q9CRZ8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tspo2Q9CRZ8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tspo2Q9CRZ8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tspo2Q9CRZ8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tspo2Q9CRZ8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tspo2Q9CRZ8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tspo2Q9CRZ8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tspo2Q9CRZ8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tspo2Q9CRZ8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Tspo2Q9CRZ8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspo2Q9CRZ8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspo2Q9CRZ8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspo2Q9CRZ8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspo2Q9CRZ8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspo2Q9CRZ8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspo2Q9CRZ8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspo2Q9CRZ8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspo2Q9CRZ8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspo2Q9CRZ8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspo2Q9CRZ8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspo2Q9CRZ8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms