Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQN7

Mrpl41, 39S ribosomal protein L41, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 135 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl41Q9CQN7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mrpl41Q9CQN7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mrpl41Q9CQN7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Mrpl41Q9CQN7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Mrpl41Q9CQN7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Mrpl41Q9CQN7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mrpl41Q9CQN7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mrpl41Q9CQN7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mrpl41Q9CQN7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mrpl41Q9CQN7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mrpl41Q9CQN7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mrpl41Q9CQN7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mrpl41Q9CQN7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mrpl41Q9CQN7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mrpl41Q9CQN7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mrpl41Q9CQN7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mrpl41Q9CQN7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mrpl41Q9CQN7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mrpl41Q9CQN7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mrpl41Q9CQN7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mrpl41Q9CQN7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mrpl41Q9CQN7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mrpl41Q9CQN7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mrpl41Q9CQN7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mrpl41Q9CQN7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mrpl41Q9CQN7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mrpl41Q9CQN7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mrpl41Q9CQN7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mrpl41Q9CQN7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mrpl41Q9CQN7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mrpl41Q9CQN7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mrpl41Q9CQN7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mrpl41Q9CQN7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mrpl41Q9CQN7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mrpl41Q9CQN7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mrpl41Q9CQN7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mrpl41Q9CQN7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mrpl41Q9CQN7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mrpl41Q9CQN7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mrpl41Q9CQN7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mrpl41Q9CQN7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Mrpl41Q9CQN7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Mrpl41Q9CQN7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mrpl41Q9CQN7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mrpl41Q9CQN7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Mrpl41Q9CQN7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Mrpl41Q9CQN7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mrpl41Q9CQN7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mrpl41Q9CQN7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mrpl41Q9CQN7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mrpl41Q9CQN7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mrpl41Q9CQN7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mrpl41Q9CQN7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mrpl41Q9CQN7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mrpl41Q9CQN7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mrpl41Q9CQN7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mrpl41Q9CQN7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mrpl41Q9CQN7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mrpl41Q9CQN7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mrpl41Q9CQN7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mrpl41Q9CQN7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mrpl41Q9CQN7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mrpl41Q9CQN7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mrpl41Q9CQN7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mrpl41Q9CQN7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mrpl41Q9CQN7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mrpl41Q9CQN7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mrpl41Q9CQN7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mrpl41Q9CQN7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mrpl41Q9CQN7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mrpl41Q9CQN7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mrpl41Q9CQN7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mrpl41Q9CQN7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mrpl41Q9CQN7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mrpl41Q9CQN7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mrpl41Q9CQN7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mrpl41Q9CQN7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mrpl41Q9CQN7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mrpl41Q9CQN7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mrpl41Q9CQN7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Mrpl41Q9CQN7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mrpl41Q9CQN7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mrpl41Q9CQN7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mrpl41Q9CQN7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mrpl41Q9CQN7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mrpl41Q9CQN7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Mrpl41Q9CQN7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mrpl41Q9CQN7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mrpl41Q9CQN7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Mrpl41Q9CQN7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mrpl41Q9CQN7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mrpl41Q9CQN7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mrpl41Q9CQN7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Mrpl41Q9CQN7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mrpl41Q9CQN7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mrpl41Q9CQN7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mrpl41Q9CQN7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Mrpl41Q9CQN7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mrpl41Q9CQN7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Mrpl41Q9CQN7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms