Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ndufb9Q9CQJ8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ndufb9Q9CQJ8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ndufb9Q9CQJ8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ndufb9Q9CQJ8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ndufb9Q9CQJ8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ndufb9Q9CQJ8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ndufb9Q9CQJ8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ndufb9Q9CQJ8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ndufb9Q9CQJ8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ndufb9Q9CQJ8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ndufb9Q9CQJ8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ndufb9Q9CQJ8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ndufb9Q9CQJ8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ndufb9Q9CQJ8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ndufb9Q9CQJ8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ndufb9Q9CQJ8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ndufb9Q9CQJ8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ndufb9Q9CQJ8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ndufb9Q9CQJ8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ndufb9Q9CQJ8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ndufb9Q9CQJ8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ndufb9Q9CQJ8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ndufb9Q9CQJ8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ndufb9Q9CQJ8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ndufb9Q9CQJ8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Ndufb9Q9CQJ8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ndufb9Q9CQJ8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ndufb9Q9CQJ8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ndufb9Q9CQJ8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ndufb9Q9CQJ8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ndufb9Q9CQJ8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ndufb9Q9CQJ8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ndufb9Q9CQJ8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ndufb9Q9CQJ8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ndufb9Q9CQJ8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ndufb9Q9CQJ8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ndufb9Q9CQJ8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ndufb9Q9CQJ8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ndufb9Q9CQJ8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ndufb9Q9CQJ8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ndufb9Q9CQJ8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ndufb9Q9CQJ8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ndufb9Q9CQJ8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ndufb9Q9CQJ8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ndufb9Q9CQJ8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ndufb9Q9CQJ8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ndufb9Q9CQJ8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ndufb9Q9CQJ8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ndufb9Q9CQJ8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ndufb9Q9CQJ8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ndufb9Q9CQJ8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ndufb9Q9CQJ8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ndufb9Q9CQJ8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ndufb9Q9CQJ8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ndufb9Q9CQJ8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ndufb9Q9CQJ8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ndufb9Q9CQJ8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ndufb9Q9CQJ8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ndufb9Q9CQJ8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ndufb9Q9CQJ8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ndufb9Q9CQJ8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ndufb9Q9CQJ8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ndufb9Q9CQJ8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ndufb9Q9CQJ8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ndufb9Q9CQJ8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ndufb9Q9CQJ8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ndufb9Q9CQJ8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ndufb9Q9CQJ8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ndufb9Q9CQJ8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ndufb9Q9CQJ8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ndufb9Q9CQJ8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ndufb9Q9CQJ8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ndufb9Q9CQJ8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ndufb9Q9CQJ8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ndufb9Q9CQJ8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ndufb9Q9CQJ8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ndufb9Q9CQJ8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ndufb9Q9CQJ8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Ndufb9Q9CQJ8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ndufb9Q9CQJ8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ndufb9Q9CQJ8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ndufb9Q9CQJ8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ndufb9Q9CQJ8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ndufb9Q9CQJ8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ndufb9Q9CQJ8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ndufb9Q9CQJ8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ndufb9Q9CQJ8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ndufb9Q9CQJ8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ndufb9Q9CQJ8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ndufb9Q9CQJ8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ndufb9Q9CQJ8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ndufb9Q9CQJ8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ndufb9Q9CQJ8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ndufb9Q9CQJ8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms