Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA3

Sdhb, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdhbQ9CQA3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SdhbQ9CQA3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SdhbQ9CQA3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SdhbQ9CQA3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SdhbQ9CQA3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SdhbQ9CQA3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SdhbQ9CQA3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SdhbQ9CQA3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SdhbQ9CQA3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SdhbQ9CQA3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SdhbQ9CQA3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SdhbQ9CQA3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SdhbQ9CQA3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SdhbQ9CQA3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SdhbQ9CQA3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SdhbQ9CQA3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SdhbQ9CQA3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SdhbQ9CQA3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SdhbQ9CQA3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SdhbQ9CQA3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SdhbQ9CQA3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SdhbQ9CQA3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SdhbQ9CQA3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SdhbQ9CQA3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SdhbQ9CQA3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SdhbQ9CQA3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SdhbQ9CQA3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SdhbQ9CQA3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SdhbQ9CQA3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SdhbQ9CQA3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SdhbQ9CQA3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SdhbQ9CQA3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SdhbQ9CQA3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SdhbQ9CQA3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SdhbQ9CQA3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SdhbQ9CQA3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SdhbQ9CQA3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SdhbQ9CQA3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SdhbQ9CQA3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SdhbQ9CQA3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SdhbQ9CQA3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SdhbQ9CQA3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SdhbQ9CQA3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SdhbQ9CQA3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SdhbQ9CQA3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SdhbQ9CQA3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SdhbQ9CQA3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SdhbQ9CQA3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SdhbQ9CQA3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SdhbQ9CQA3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SdhbQ9CQA3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SdhbQ9CQA3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SdhbQ9CQA3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SdhbQ9CQA3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SdhbQ9CQA3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SdhbQ9CQA3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SdhbQ9CQA3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SdhbQ9CQA3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SdhbQ9CQA3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SdhbQ9CQA3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SdhbQ9CQA3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SdhbQ9CQA3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SdhbQ9CQA3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SdhbQ9CQA3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SdhbQ9CQA3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SdhbQ9CQA3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SdhbQ9CQA3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SdhbQ9CQA3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SdhbQ9CQA3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SdhbQ9CQA3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SdhbQ9CQA3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SdhbQ9CQA3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SdhbQ9CQA3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SdhbQ9CQA3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SdhbQ9CQA3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SdhbQ9CQA3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SdhbQ9CQA3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SdhbQ9CQA3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SdhbQ9CQA3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SdhbQ9CQA3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SdhbQ9CQA3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SdhbQ9CQA3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SdhbQ9CQA3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SdhbQ9CQA3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SdhbQ9CQA3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SdhbQ9CQA3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SdhbQ9CQA3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SdhbQ9CQA3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SdhbQ9CQA3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SdhbQ9CQA3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SdhbQ9CQA3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SdhbQ9CQA3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SdhbQ9CQA3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SdhbQ9CQA3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SdhbQ9CQA3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SdhbQ9CQA3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SdhbQ9CQA3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SdhbQ9CQA3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SdhbQ9CQA3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SdhbQ9CQA3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms