Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ07

Lrrc18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc18Q9CQ07 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lrrc18Q9CQ07 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lrrc18Q9CQ07 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lrrc18Q9CQ07 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lrrc18Q9CQ07 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lrrc18Q9CQ07 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lrrc18Q9CQ07 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lrrc18Q9CQ07 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lrrc18Q9CQ07 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lrrc18Q9CQ07 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lrrc18Q9CQ07 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lrrc18Q9CQ07 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lrrc18Q9CQ07 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Lrrc18Q9CQ07 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lrrc18Q9CQ07 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lrrc18Q9CQ07 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lrrc18Q9CQ07 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lrrc18Q9CQ07 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lrrc18Q9CQ07 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lrrc18Q9CQ07 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lrrc18Q9CQ07 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lrrc18Q9CQ07 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lrrc18Q9CQ07 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lrrc18Q9CQ07 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lrrc18Q9CQ07 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lrrc18Q9CQ07 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lrrc18Q9CQ07 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lrrc18Q9CQ07 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lrrc18Q9CQ07 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lrrc18Q9CQ07 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Lrrc18Q9CQ07 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lrrc18Q9CQ07 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lrrc18Q9CQ07 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lrrc18Q9CQ07 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lrrc18Q9CQ07 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lrrc18Q9CQ07 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lrrc18Q9CQ07 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lrrc18Q9CQ07 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lrrc18Q9CQ07 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lrrc18Q9CQ07 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lrrc18Q9CQ07 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lrrc18Q9CQ07 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lrrc18Q9CQ07 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lrrc18Q9CQ07 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lrrc18Q9CQ07 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lrrc18Q9CQ07 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lrrc18Q9CQ07 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lrrc18Q9CQ07 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lrrc18Q9CQ07 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lrrc18Q9CQ07 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrrc18Q9CQ07 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrrc18Q9CQ07 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrrc18Q9CQ07 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrrc18Q9CQ07 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrrc18Q9CQ07 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrrc18Q9CQ07 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrrc18Q9CQ07 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrc18Q9CQ07 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrc18Q9CQ07 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrc18Q9CQ07 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrc18Q9CQ07 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrc18Q9CQ07 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrc18Q9CQ07 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrc18Q9CQ07 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrc18Q9CQ07 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrc18Q9CQ07 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrc18Q9CQ07 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrc18Q9CQ07 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrc18Q9CQ07 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrc18Q9CQ07 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrc18Q9CQ07 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrc18Q9CQ07 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrrc18Q9CQ07 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrrc18Q9CQ07 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrrc18Q9CQ07 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrrc18Q9CQ07 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrrc18Q9CQ07 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrrc18Q9CQ07 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lrrc18Q9CQ07 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrc18Q9CQ07 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrc18Q9CQ07 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrc18Q9CQ07 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrc18Q9CQ07 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrc18Q9CQ07 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrc18Q9CQ07 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrc18Q9CQ07 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrc18Q9CQ07 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrc18Q9CQ07 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrc18Q9CQ07 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrc18Q9CQ07 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrc18Q9CQ07 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrc18Q9CQ07 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrc18Q9CQ07 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrc18Q9CQ07 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrc18Q9CQ07 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrc18Q9CQ07 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrc18Q9CQ07 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrc18Q9CQ07 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrc18Q9CQ07 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrc18Q9CQ07 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms