Protein–RNA interactions for Protein: Q99PJ2

Trim8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim8Q99PJ2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim8Q99PJ2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim8Q99PJ2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim8Q99PJ2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim8Q99PJ2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim8Q99PJ2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim8Q99PJ2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim8Q99PJ2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim8Q99PJ2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim8Q99PJ2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim8Q99PJ2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim8Q99PJ2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim8Q99PJ2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim8Q99PJ2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim8Q99PJ2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim8Q99PJ2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim8Q99PJ2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim8Q99PJ2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim8Q99PJ2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim8Q99PJ2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim8Q99PJ2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim8Q99PJ2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim8Q99PJ2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim8Q99PJ2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim8Q99PJ2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim8Q99PJ2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim8Q99PJ2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim8Q99PJ2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim8Q99PJ2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim8Q99PJ2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim8Q99PJ2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim8Q99PJ2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim8Q99PJ2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim8Q99PJ2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim8Q99PJ2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim8Q99PJ2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim8Q99PJ2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim8Q99PJ2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim8Q99PJ2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim8Q99PJ2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim8Q99PJ2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim8Q99PJ2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim8Q99PJ2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim8Q99PJ2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim8Q99PJ2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim8Q99PJ2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim8Q99PJ2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim8Q99PJ2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim8Q99PJ2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim8Q99PJ2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim8Q99PJ2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim8Q99PJ2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim8Q99PJ2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim8Q99PJ2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim8Q99PJ2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim8Q99PJ2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim8Q99PJ2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim8Q99PJ2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim8Q99PJ2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim8Q99PJ2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trim8Q99PJ2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trim8Q99PJ2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim8Q99PJ2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim8Q99PJ2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim8Q99PJ2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim8Q99PJ2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim8Q99PJ2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim8Q99PJ2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim8Q99PJ2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim8Q99PJ2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim8Q99PJ2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim8Q99PJ2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim8Q99PJ2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim8Q99PJ2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim8Q99PJ2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim8Q99PJ2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim8Q99PJ2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim8Q99PJ2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim8Q99PJ2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim8Q99PJ2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim8Q99PJ2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim8Q99PJ2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim8Q99PJ2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim8Q99PJ2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim8Q99PJ2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim8Q99PJ2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim8Q99PJ2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim8Q99PJ2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim8Q99PJ2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim8Q99PJ2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim8Q99PJ2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim8Q99PJ2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim8Q99PJ2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim8Q99PJ2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim8Q99PJ2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim8Q99PJ2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim8Q99PJ2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim8Q99PJ2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim8Q99PJ2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim8Q99PJ2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms