Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smim3Q99PE5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smim3Q99PE5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smim3Q99PE5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smim3Q99PE5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smim3Q99PE5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smim3Q99PE5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smim3Q99PE5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smim3Q99PE5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smim3Q99PE5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smim3Q99PE5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smim3Q99PE5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smim3Q99PE5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smim3Q99PE5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smim3Q99PE5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smim3Q99PE5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smim3Q99PE5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smim3Q99PE5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smim3Q99PE5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smim3Q99PE5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smim3Q99PE5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smim3Q99PE5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smim3Q99PE5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smim3Q99PE5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smim3Q99PE5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smim3Q99PE5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smim3Q99PE5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smim3Q99PE5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smim3Q99PE5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Smim3Q99PE5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smim3Q99PE5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smim3Q99PE5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smim3Q99PE5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smim3Q99PE5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Smim3Q99PE5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smim3Q99PE5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smim3Q99PE5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smim3Q99PE5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smim3Q99PE5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smim3Q99PE5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smim3Q99PE5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smim3Q99PE5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smim3Q99PE5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smim3Q99PE5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smim3Q99PE5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smim3Q99PE5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smim3Q99PE5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smim3Q99PE5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smim3Q99PE5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smim3Q99PE5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smim3Q99PE5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smim3Q99PE5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smim3Q99PE5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smim3Q99PE5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smim3Q99PE5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smim3Q99PE5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smim3Q99PE5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smim3Q99PE5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smim3Q99PE5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smim3Q99PE5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smim3Q99PE5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smim3Q99PE5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smim3Q99PE5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Smim3Q99PE5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smim3Q99PE5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smim3Q99PE5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smim3Q99PE5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smim3Q99PE5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smim3Q99PE5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Smim3Q99PE5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smim3Q99PE5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smim3Q99PE5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smim3Q99PE5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smim3Q99PE5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Smim3Q99PE5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smim3Q99PE5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smim3Q99PE5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smim3Q99PE5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smim3Q99PE5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smim3Q99PE5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smim3Q99PE5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smim3Q99PE5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smim3Q99PE5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smim3Q99PE5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smim3Q99PE5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smim3Q99PE5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smim3Q99PE5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Smim3Q99PE5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smim3Q99PE5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smim3Q99PE5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smim3Q99PE5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smim3Q99PE5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smim3Q99PE5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smim3Q99PE5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smim3Q99PE5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smim3Q99PE5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smim3Q99PE5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smim3Q99PE5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smim3Q99PE5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smim3Q99PE5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms