Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gtpbp4Q99ME9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gtpbp4Q99ME9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gtpbp4Q99ME9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gtpbp4Q99ME9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gtpbp4Q99ME9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gtpbp4Q99ME9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gtpbp4Q99ME9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gtpbp4Q99ME9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gtpbp4Q99ME9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gtpbp4Q99ME9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gtpbp4Q99ME9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gtpbp4Q99ME9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gtpbp4Q99ME9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtpbp4Q99ME9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtpbp4Q99ME9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtpbp4Q99ME9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtpbp4Q99ME9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtpbp4Q99ME9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gtpbp4Q99ME9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gtpbp4Q99ME9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gtpbp4Q99ME9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gtpbp4Q99ME9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtpbp4Q99ME9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtpbp4Q99ME9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gtpbp4Q99ME9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gtpbp4Q99ME9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gtpbp4Q99ME9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gtpbp4Q99ME9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gtpbp4Q99ME9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gtpbp4Q99ME9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gtpbp4Q99ME9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gtpbp4Q99ME9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gtpbp4Q99ME9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gtpbp4Q99ME9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gtpbp4Q99ME9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gtpbp4Q99ME9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gtpbp4Q99ME9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gtpbp4Q99ME9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gtpbp4Q99ME9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gtpbp4Q99ME9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gtpbp4Q99ME9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gtpbp4Q99ME9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gtpbp4Q99ME9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtpbp4Q99ME9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtpbp4Q99ME9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtpbp4Q99ME9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtpbp4Q99ME9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtpbp4Q99ME9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtpbp4Q99ME9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtpbp4Q99ME9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gtpbp4Q99ME9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gtpbp4Q99ME9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gtpbp4Q99ME9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gtpbp4Q99ME9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gtpbp4Q99ME9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gtpbp4Q99ME9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gtpbp4Q99ME9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gtpbp4Q99ME9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gtpbp4Q99ME9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gtpbp4Q99ME9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gtpbp4Q99ME9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gtpbp4Q99ME9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Gtpbp4Q99ME9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Gtpbp4Q99ME9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gtpbp4Q99ME9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gtpbp4Q99ME9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gtpbp4Q99ME9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gtpbp4Q99ME9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gtpbp4Q99ME9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gtpbp4Q99ME9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gtpbp4Q99ME9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gtpbp4Q99ME9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gtpbp4Q99ME9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gtpbp4Q99ME9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gtpbp4Q99ME9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gtpbp4Q99ME9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gtpbp4Q99ME9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gtpbp4Q99ME9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtpbp4Q99ME9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtpbp4Q99ME9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtpbp4Q99ME9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtpbp4Q99ME9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtpbp4Q99ME9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtpbp4Q99ME9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtpbp4Q99ME9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtpbp4Q99ME9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtpbp4Q99ME9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Gtpbp4Q99ME9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gtpbp4Q99ME9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Gtpbp4Q99ME9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gtpbp4Q99ME9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gtpbp4Q99ME9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gtpbp4Q99ME9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gtpbp4Q99ME9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gtpbp4Q99ME9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gtpbp4Q99ME9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gtpbp4Q99ME9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gtpbp4Q99ME9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gtpbp4Q99ME9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms