Protein–RNA interactions for Protein: Q99M71

Epdr1, Mammalian ependymin-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epdr1Q99M71 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Epdr1Q99M71 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Epdr1Q99M71 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Epdr1Q99M71 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Epdr1Q99M71 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Epdr1Q99M71 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Epdr1Q99M71 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Epdr1Q99M71 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Epdr1Q99M71 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Epdr1Q99M71 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Epdr1Q99M71 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Epdr1Q99M71 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Epdr1Q99M71 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Epdr1Q99M71 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Epdr1Q99M71 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Epdr1Q99M71 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Epdr1Q99M71 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Epdr1Q99M71 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Epdr1Q99M71 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Epdr1Q99M71 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Epdr1Q99M71 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Epdr1Q99M71 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Epdr1Q99M71 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Epdr1Q99M71 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Epdr1Q99M71 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Epdr1Q99M71 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Epdr1Q99M71 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Epdr1Q99M71 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Epdr1Q99M71 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Epdr1Q99M71 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Epdr1Q99M71 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Epdr1Q99M71 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Epdr1Q99M71 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Epdr1Q99M71 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Epdr1Q99M71 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Epdr1Q99M71 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Epdr1Q99M71 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Epdr1Q99M71 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Epdr1Q99M71 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Epdr1Q99M71 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Epdr1Q99M71 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Epdr1Q99M71 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Epdr1Q99M71 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Epdr1Q99M71 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Epdr1Q99M71 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Epdr1Q99M71 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Epdr1Q99M71 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Epdr1Q99M71 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Epdr1Q99M71 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Epdr1Q99M71 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Epdr1Q99M71 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Epdr1Q99M71 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Epdr1Q99M71 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Epdr1Q99M71 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Epdr1Q99M71 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Epdr1Q99M71 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Epdr1Q99M71 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Epdr1Q99M71 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Epdr1Q99M71 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Epdr1Q99M71 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Epdr1Q99M71 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Epdr1Q99M71 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Epdr1Q99M71 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Epdr1Q99M71 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Epdr1Q99M71 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Epdr1Q99M71 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Epdr1Q99M71 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Epdr1Q99M71 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Epdr1Q99M71 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Epdr1Q99M71 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Epdr1Q99M71 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Epdr1Q99M71 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Epdr1Q99M71 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Epdr1Q99M71 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Epdr1Q99M71 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Epdr1Q99M71 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Epdr1Q99M71 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Epdr1Q99M71 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Epdr1Q99M71 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Epdr1Q99M71 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Epdr1Q99M71 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Epdr1Q99M71 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Epdr1Q99M71 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Epdr1Q99M71 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Epdr1Q99M71 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Epdr1Q99M71 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Epdr1Q99M71 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Epdr1Q99M71 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Epdr1Q99M71 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Epdr1Q99M71 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Epdr1Q99M71 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Epdr1Q99M71 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Epdr1Q99M71 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Epdr1Q99M71 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Epdr1Q99M71 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Epdr1Q99M71 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Epdr1Q99M71 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Epdr1Q99M71 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Epdr1Q99M71 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Epdr1Q99M71 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms