Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pacsin3Q99JB8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pacsin3Q99JB8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pacsin3Q99JB8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pacsin3Q99JB8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pacsin3Q99JB8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pacsin3Q99JB8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pacsin3Q99JB8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pacsin3Q99JB8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pacsin3Q99JB8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pacsin3Q99JB8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pacsin3Q99JB8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pacsin3Q99JB8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pacsin3Q99JB8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pacsin3Q99JB8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pacsin3Q99JB8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pacsin3Q99JB8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pacsin3Q99JB8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pacsin3Q99JB8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pacsin3Q99JB8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Pacsin3Q99JB8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pacsin3Q99JB8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pacsin3Q99JB8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pacsin3Q99JB8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pacsin3Q99JB8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pacsin3Q99JB8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pacsin3Q99JB8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pacsin3Q99JB8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pacsin3Q99JB8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pacsin3Q99JB8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pacsin3Q99JB8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pacsin3Q99JB8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pacsin3Q99JB8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Pacsin3Q99JB8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Pacsin3Q99JB8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pacsin3Q99JB8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pacsin3Q99JB8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pacsin3Q99JB8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pacsin3Q99JB8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pacsin3Q99JB8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pacsin3Q99JB8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pacsin3Q99JB8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pacsin3Q99JB8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pacsin3Q99JB8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pacsin3Q99JB8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pacsin3Q99JB8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pacsin3Q99JB8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pacsin3Q99JB8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Pacsin3Q99JB8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pacsin3Q99JB8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pacsin3Q99JB8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Pacsin3Q99JB8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pacsin3Q99JB8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pacsin3Q99JB8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pacsin3Q99JB8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pacsin3Q99JB8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pacsin3Q99JB8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pacsin3Q99JB8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pacsin3Q99JB8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pacsin3Q99JB8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Pacsin3Q99JB8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pacsin3Q99JB8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pacsin3Q99JB8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pacsin3Q99JB8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pacsin3Q99JB8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pacsin3Q99JB8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pacsin3Q99JB8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pacsin3Q99JB8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pacsin3Q99JB8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pacsin3Q99JB8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pacsin3Q99JB8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pacsin3Q99JB8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pacsin3Q99JB8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pacsin3Q99JB8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Pacsin3Q99JB8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pacsin3Q99JB8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pacsin3Q99JB8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pacsin3Q99JB8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pacsin3Q99JB8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pacsin3Q99JB8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pacsin3Q99JB8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pacsin3Q99JB8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pacsin3Q99JB8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pacsin3Q99JB8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pacsin3Q99JB8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pacsin3Q99JB8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pacsin3Q99JB8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pacsin3Q99JB8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pacsin3Q99JB8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pacsin3Q99JB8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pacsin3Q99JB8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Pacsin3Q99JB8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pacsin3Q99JB8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pacsin3Q99JB8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pacsin3Q99JB8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pacsin3Q99JB8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pacsin3Q99JB8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pacsin3Q99JB8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pacsin3Q99JB8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pacsin3Q99JB8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms