Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tspan1Q99J59 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tspan1Q99J59 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tspan1Q99J59 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tspan1Q99J59 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tspan1Q99J59 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tspan1Q99J59 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tspan1Q99J59 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tspan1Q99J59 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tspan1Q99J59 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tspan1Q99J59 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tspan1Q99J59 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tspan1Q99J59 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tspan1Q99J59 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tspan1Q99J59 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tspan1Q99J59 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tspan1Q99J59 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tspan1Q99J59 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tspan1Q99J59 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tspan1Q99J59 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tspan1Q99J59 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tspan1Q99J59 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tspan1Q99J59 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tspan1Q99J59 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tspan1Q99J59 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tspan1Q99J59 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tspan1Q99J59 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tspan1Q99J59 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tspan1Q99J59 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tspan1Q99J59 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tspan1Q99J59 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tspan1Q99J59 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tspan1Q99J59 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tspan1Q99J59 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tspan1Q99J59 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tspan1Q99J59 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tspan1Q99J59 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tspan1Q99J59 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tspan1Q99J59 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tspan1Q99J59 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tspan1Q99J59 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tspan1Q99J59 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tspan1Q99J59 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tspan1Q99J59 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tspan1Q99J59 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tspan1Q99J59 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tspan1Q99J59 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tspan1Q99J59 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tspan1Q99J59 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tspan1Q99J59 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tspan1Q99J59 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tspan1Q99J59 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tspan1Q99J59 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tspan1Q99J59 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tspan1Q99J59 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tspan1Q99J59 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tspan1Q99J59 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tspan1Q99J59 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tspan1Q99J59 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tspan1Q99J59 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tspan1Q99J59 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tspan1Q99J59 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tspan1Q99J59 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tspan1Q99J59 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tspan1Q99J59 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tspan1Q99J59 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tspan1Q99J59 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tspan1Q99J59 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tspan1Q99J59 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tspan1Q99J59 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tspan1Q99J59 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tspan1Q99J59 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tspan1Q99J59 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tspan1Q99J59 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tspan1Q99J59 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tspan1Q99J59 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tspan1Q99J59 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tspan1Q99J59 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tspan1Q99J59 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tspan1Q99J59 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tspan1Q99J59 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tspan1Q99J59 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tspan1Q99J59 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tspan1Q99J59 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tspan1Q99J59 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tspan1Q99J59 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tspan1Q99J59 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tspan1Q99J59 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tspan1Q99J59 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tspan1Q99J59 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tspan1Q99J59 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tspan1Q99J59 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tspan1Q99J59 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tspan1Q99J59 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tspan1Q99J59 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tspan1Q99J59 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tspan1Q99J59 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tspan1Q99J59 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tspan1Q99J59 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tspan1Q99J59 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms