Protein–RNA interactions for Protein: Q99J25

Mrm1, rRNA methyltransferase 1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrm1Q99J25 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mrm1Q99J25 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mrm1Q99J25 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mrm1Q99J25 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mrm1Q99J25 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mrm1Q99J25 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mrm1Q99J25 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mrm1Q99J25 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mrm1Q99J25 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mrm1Q99J25 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mrm1Q99J25 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mrm1Q99J25 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mrm1Q99J25 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mrm1Q99J25 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mrm1Q99J25 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Mrm1Q99J25 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mrm1Q99J25 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Mrm1Q99J25 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mrm1Q99J25 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mrm1Q99J25 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mrm1Q99J25 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mrm1Q99J25 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mrm1Q99J25 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mrm1Q99J25 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mrm1Q99J25 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mrm1Q99J25 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mrm1Q99J25 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mrm1Q99J25 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mrm1Q99J25 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mrm1Q99J25 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mrm1Q99J25 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mrm1Q99J25 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Mrm1Q99J25 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Mrm1Q99J25 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mrm1Q99J25 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mrm1Q99J25 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mrm1Q99J25 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mrm1Q99J25 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mrm1Q99J25 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Mrm1Q99J25 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mrm1Q99J25 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mrm1Q99J25 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mrm1Q99J25 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mrm1Q99J25 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mrm1Q99J25 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mrm1Q99J25 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mrm1Q99J25 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mrm1Q99J25 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mrm1Q99J25 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Mrm1Q99J25 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mrm1Q99J25 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mrm1Q99J25 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mrm1Q99J25 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mrm1Q99J25 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mrm1Q99J25 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mrm1Q99J25 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mrm1Q99J25 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mrm1Q99J25 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mrm1Q99J25 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mrm1Q99J25 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mrm1Q99J25 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mrm1Q99J25 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mrm1Q99J25 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mrm1Q99J25 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mrm1Q99J25 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mrm1Q99J25 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mrm1Q99J25 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mrm1Q99J25 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mrm1Q99J25 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mrm1Q99J25 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mrm1Q99J25 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mrm1Q99J25 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mrm1Q99J25 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mrm1Q99J25 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mrm1Q99J25 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mrm1Q99J25 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mrm1Q99J25 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mrm1Q99J25 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mrm1Q99J25 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mrm1Q99J25 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mrm1Q99J25 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mrm1Q99J25 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mrm1Q99J25 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mrm1Q99J25 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mrm1Q99J25 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mrm1Q99J25 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mrm1Q99J25 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mrm1Q99J25 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mrm1Q99J25 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mrm1Q99J25 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mrm1Q99J25 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mrm1Q99J25 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mrm1Q99J25 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mrm1Q99J25 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mrm1Q99J25 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mrm1Q99J25 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mrm1Q99J25 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mrm1Q99J25 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mrm1Q99J25 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mrm1Q99J25 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms