Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smim11aQ99J19 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smim11aQ99J19 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smim11aQ99J19 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Smim11aQ99J19 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smim11aQ99J19 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smim11aQ99J19 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smim11aQ99J19 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smim11aQ99J19 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smim11aQ99J19 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smim11aQ99J19 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smim11aQ99J19 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smim11aQ99J19 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smim11aQ99J19 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smim11aQ99J19 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smim11aQ99J19 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smim11aQ99J19 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smim11aQ99J19 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smim11aQ99J19 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smim11aQ99J19 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smim11aQ99J19 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smim11aQ99J19 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smim11aQ99J19 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smim11aQ99J19 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smim11aQ99J19 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smim11aQ99J19 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smim11aQ99J19 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smim11aQ99J19 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smim11aQ99J19 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smim11aQ99J19 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smim11aQ99J19 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smim11aQ99J19 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smim11aQ99J19 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Smim11aQ99J19 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smim11aQ99J19 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smim11aQ99J19 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smim11aQ99J19 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smim11aQ99J19 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smim11aQ99J19 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smim11aQ99J19 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smim11aQ99J19 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smim11aQ99J19 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smim11aQ99J19 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smim11aQ99J19 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Smim11aQ99J19 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smim11aQ99J19 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smim11aQ99J19 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smim11aQ99J19 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smim11aQ99J19 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smim11aQ99J19 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smim11aQ99J19 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smim11aQ99J19 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smim11aQ99J19 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smim11aQ99J19 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smim11aQ99J19 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smim11aQ99J19 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smim11aQ99J19 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smim11aQ99J19 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smim11aQ99J19 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smim11aQ99J19 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smim11aQ99J19 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smim11aQ99J19 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smim11aQ99J19 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smim11aQ99J19 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smim11aQ99J19 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smim11aQ99J19 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smim11aQ99J19 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smim11aQ99J19 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Smim11aQ99J19 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Smim11aQ99J19 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smim11aQ99J19 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smim11aQ99J19 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smim11aQ99J19 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smim11aQ99J19 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smim11aQ99J19 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smim11aQ99J19 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smim11aQ99J19 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smim11aQ99J19 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smim11aQ99J19 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smim11aQ99J19 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smim11aQ99J19 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smim11aQ99J19 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smim11aQ99J19 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Smim11aQ99J19 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Smim11aQ99J19 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smim11aQ99J19 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smim11aQ99J19 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smim11aQ99J19 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smim11aQ99J19 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smim11aQ99J19 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smim11aQ99J19 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Smim11aQ99J19 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smim11aQ99J19 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smim11aQ99J19 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smim11aQ99J19 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smim11aQ99J19 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smim11aQ99J19 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smim11aQ99J19 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Smim11aQ99J19 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Smim11aQ99J19 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
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