Protein–RNA interactions for Protein: Q923K4

Gtpbp3, tRNA modification GTPase GTPBP3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp3Q923K4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtpbp3Q923K4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtpbp3Q923K4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtpbp3Q923K4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtpbp3Q923K4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtpbp3Q923K4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtpbp3Q923K4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtpbp3Q923K4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtpbp3Q923K4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtpbp3Q923K4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtpbp3Q923K4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtpbp3Q923K4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtpbp3Q923K4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtpbp3Q923K4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtpbp3Q923K4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtpbp3Q923K4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtpbp3Q923K4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gtpbp3Q923K4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gtpbp3Q923K4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gtpbp3Q923K4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Gtpbp3Q923K4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gtpbp3Q923K4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Gtpbp3Q923K4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gtpbp3Q923K4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gtpbp3Q923K4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Gtpbp3Q923K4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtpbp3Q923K4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtpbp3Q923K4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtpbp3Q923K4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtpbp3Q923K4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtpbp3Q923K4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtpbp3Q923K4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtpbp3Q923K4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtpbp3Q923K4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtpbp3Q923K4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtpbp3Q923K4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtpbp3Q923K4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtpbp3Q923K4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtpbp3Q923K4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtpbp3Q923K4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtpbp3Q923K4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtpbp3Q923K4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtpbp3Q923K4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtpbp3Q923K4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtpbp3Q923K4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtpbp3Q923K4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtpbp3Q923K4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtpbp3Q923K4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtpbp3Q923K4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtpbp3Q923K4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtpbp3Q923K4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtpbp3Q923K4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtpbp3Q923K4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtpbp3Q923K4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtpbp3Q923K4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtpbp3Q923K4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtpbp3Q923K4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtpbp3Q923K4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtpbp3Q923K4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtpbp3Q923K4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtpbp3Q923K4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtpbp3Q923K4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtpbp3Q923K4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtpbp3Q923K4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtpbp3Q923K4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtpbp3Q923K4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtpbp3Q923K4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtpbp3Q923K4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtpbp3Q923K4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtpbp3Q923K4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtpbp3Q923K4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtpbp3Q923K4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtpbp3Q923K4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtpbp3Q923K4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtpbp3Q923K4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtpbp3Q923K4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtpbp3Q923K4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtpbp3Q923K4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtpbp3Q923K4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtpbp3Q923K4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtpbp3Q923K4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtpbp3Q923K4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtpbp3Q923K4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtpbp3Q923K4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtpbp3Q923K4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gtpbp3Q923K4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtpbp3Q923K4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtpbp3Q923K4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtpbp3Q923K4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtpbp3Q923K4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtpbp3Q923K4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtpbp3Q923K4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtpbp3Q923K4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtpbp3Q923K4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtpbp3Q923K4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtpbp3Q923K4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtpbp3Q923K4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtpbp3Q923K4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtpbp3Q923K4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtpbp3Q923K4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms