Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prpf3Q922U1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prpf3Q922U1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prpf3Q922U1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prpf3Q922U1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prpf3Q922U1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prpf3Q922U1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prpf3Q922U1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Prpf3Q922U1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prpf3Q922U1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prpf3Q922U1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prpf3Q922U1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prpf3Q922U1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prpf3Q922U1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prpf3Q922U1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prpf3Q922U1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prpf3Q922U1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prpf3Q922U1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prpf3Q922U1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Prpf3Q922U1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Prpf3Q922U1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Prpf3Q922U1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prpf3Q922U1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prpf3Q922U1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Prpf3Q922U1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prpf3Q922U1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prpf3Q922U1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prpf3Q922U1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prpf3Q922U1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prpf3Q922U1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prpf3Q922U1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prpf3Q922U1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prpf3Q922U1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prpf3Q922U1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prpf3Q922U1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prpf3Q922U1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prpf3Q922U1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prpf3Q922U1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prpf3Q922U1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prpf3Q922U1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prpf3Q922U1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prpf3Q922U1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prpf3Q922U1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prpf3Q922U1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prpf3Q922U1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prpf3Q922U1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prpf3Q922U1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prpf3Q922U1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prpf3Q922U1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prpf3Q922U1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Prpf3Q922U1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prpf3Q922U1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prpf3Q922U1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prpf3Q922U1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prpf3Q922U1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prpf3Q922U1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Prpf3Q922U1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Prpf3Q922U1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Prpf3Q922U1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Prpf3Q922U1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prpf3Q922U1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prpf3Q922U1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prpf3Q922U1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prpf3Q922U1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prpf3Q922U1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Prpf3Q922U1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Prpf3Q922U1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Prpf3Q922U1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prpf3Q922U1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prpf3Q922U1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prpf3Q922U1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Prpf3Q922U1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Prpf3Q922U1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prpf3Q922U1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prpf3Q922U1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prpf3Q922U1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prpf3Q922U1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prpf3Q922U1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prpf3Q922U1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prpf3Q922U1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prpf3Q922U1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prpf3Q922U1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prpf3Q922U1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prpf3Q922U1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prpf3Q922U1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prpf3Q922U1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prpf3Q922U1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prpf3Q922U1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prpf3Q922U1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prpf3Q922U1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prpf3Q922U1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prpf3Q922U1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prpf3Q922U1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Prpf3Q922U1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prpf3Q922U1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prpf3Q922U1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prpf3Q922U1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prpf3Q922U1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prpf3Q922U1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prpf3Q922U1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 178.9 ms