Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y18

Pcdha12, Protocadherin alpha 12, mousemouse

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha12Q91Y18 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcdha12Q91Y18 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcdha12Q91Y18 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcdha12Q91Y18 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcdha12Q91Y18 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcdha12Q91Y18 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcdha12Q91Y18 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcdha12Q91Y18 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcdha12Q91Y18 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Pcdha12Q91Y18 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Pcdha12Q91Y18 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pcdha12Q91Y18 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcdha12Q91Y18 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcdha12Q91Y18 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcdha12Q91Y18 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcdha12Q91Y18 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcdha12Q91Y18 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcdha12Q91Y18 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcdha12Q91Y18 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcdha12Q91Y18 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcdha12Q91Y18 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcdha12Q91Y18 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcdha12Q91Y18 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcdha12Q91Y18 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcdha12Q91Y18 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcdha12Q91Y18 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcdha12Q91Y18 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcdha12Q91Y18 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pcdha12Q91Y18 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Pcdha12Q91Y18 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pcdha12Q91Y18 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pcdha12Q91Y18 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pcdha12Q91Y18 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pcdha12Q91Y18 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pcdha12Q91Y18 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pcdha12Q91Y18 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Pcdha12Q91Y18 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pcdha12Q91Y18 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pcdha12Q91Y18 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pcdha12Q91Y18 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Pcdha12Q91Y18 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pcdha12Q91Y18 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pcdha12Q91Y18 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pcdha12Q91Y18 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pcdha12Q91Y18 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcdha12Q91Y18 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcdha12Q91Y18 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcdha12Q91Y18 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcdha12Q91Y18 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcdha12Q91Y18 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcdha12Q91Y18 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcdha12Q91Y18 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcdha12Q91Y18 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcdha12Q91Y18 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcdha12Q91Y18 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcdha12Q91Y18 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcdha12Q91Y18 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcdha12Q91Y18 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcdha12Q91Y18 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcdha12Q91Y18 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcdha12Q91Y18 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcdha12Q91Y18 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcdha12Q91Y18 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcdha12Q91Y18 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcdha12Q91Y18 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcdha12Q91Y18 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcdha12Q91Y18 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcdha12Q91Y18 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcdha12Q91Y18 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcdha12Q91Y18 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcdha12Q91Y18 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcdha12Q91Y18 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcdha12Q91Y18 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcdha12Q91Y18 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcdha12Q91Y18 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcdha12Q91Y18 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcdha12Q91Y18 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcdha12Q91Y18 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcdha12Q91Y18 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcdha12Q91Y18 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcdha12Q91Y18 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcdha12Q91Y18 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcdha12Q91Y18 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcdha12Q91Y18 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcdha12Q91Y18 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcdha12Q91Y18 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdha12Q91Y18 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdha12Q91Y18 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdha12Q91Y18 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdha12Q91Y18 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdha12Q91Y18 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdha12Q91Y18 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdha12Q91Y18 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdha12Q91Y18 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcdha12Q91Y18 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcdha12Q91Y18 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcdha12Q91Y18 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcdha12Q91Y18 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcdha12Q91Y18 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcdha12Q91Y18 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms