Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usb1Q91W78 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usb1Q91W78 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usb1Q91W78 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Usb1Q91W78 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usb1Q91W78 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usb1Q91W78 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usb1Q91W78 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usb1Q91W78 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usb1Q91W78 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usb1Q91W78 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usb1Q91W78 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usb1Q91W78 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usb1Q91W78 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usb1Q91W78 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usb1Q91W78 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usb1Q91W78 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usb1Q91W78 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usb1Q91W78 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usb1Q91W78 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usb1Q91W78 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usb1Q91W78 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usb1Q91W78 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usb1Q91W78 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usb1Q91W78 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Usb1Q91W78 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usb1Q91W78 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usb1Q91W78 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usb1Q91W78 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usb1Q91W78 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usb1Q91W78 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usb1Q91W78 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usb1Q91W78 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Usb1Q91W78 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Usb1Q91W78 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usb1Q91W78 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usb1Q91W78 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usb1Q91W78 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usb1Q91W78 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usb1Q91W78 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usb1Q91W78 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usb1Q91W78 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usb1Q91W78 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usb1Q91W78 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usb1Q91W78 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usb1Q91W78 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usb1Q91W78 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usb1Q91W78 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usb1Q91W78 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usb1Q91W78 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usb1Q91W78 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usb1Q91W78 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usb1Q91W78 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usb1Q91W78 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usb1Q91W78 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usb1Q91W78 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usb1Q91W78 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usb1Q91W78 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Usb1Q91W78 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usb1Q91W78 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usb1Q91W78 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usb1Q91W78 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usb1Q91W78 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usb1Q91W78 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usb1Q91W78 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usb1Q91W78 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Usb1Q91W78 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Usb1Q91W78 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Usb1Q91W78 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usb1Q91W78 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usb1Q91W78 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usb1Q91W78 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usb1Q91W78 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usb1Q91W78 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usb1Q91W78 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usb1Q91W78 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usb1Q91W78 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usb1Q91W78 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usb1Q91W78 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usb1Q91W78 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usb1Q91W78 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Usb1Q91W78 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usb1Q91W78 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usb1Q91W78 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Usb1Q91W78 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Usb1Q91W78 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usb1Q91W78 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usb1Q91W78 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usb1Q91W78 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Usb1Q91W78 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usb1Q91W78 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Usb1Q91W78 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Usb1Q91W78 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usb1Q91W78 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usb1Q91W78 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usb1Q91W78 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usb1Q91W78 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usb1Q91W78 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usb1Q91W78 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usb1Q91W78 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.6 ms