Protein–RNA interactions for Protein: Q91VT1

Nsmce2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce2Q91VT1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nsmce2Q91VT1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nsmce2Q91VT1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nsmce2Q91VT1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nsmce2Q91VT1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nsmce2Q91VT1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nsmce2Q91VT1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Nsmce2Q91VT1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nsmce2Q91VT1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nsmce2Q91VT1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nsmce2Q91VT1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nsmce2Q91VT1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nsmce2Q91VT1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nsmce2Q91VT1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nsmce2Q91VT1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nsmce2Q91VT1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nsmce2Q91VT1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nsmce2Q91VT1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nsmce2Q91VT1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nsmce2Q91VT1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nsmce2Q91VT1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nsmce2Q91VT1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nsmce2Q91VT1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Nsmce2Q91VT1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nsmce2Q91VT1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nsmce2Q91VT1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nsmce2Q91VT1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nsmce2Q91VT1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nsmce2Q91VT1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nsmce2Q91VT1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nsmce2Q91VT1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nsmce2Q91VT1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nsmce2Q91VT1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nsmce2Q91VT1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nsmce2Q91VT1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nsmce2Q91VT1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nsmce2Q91VT1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nsmce2Q91VT1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nsmce2Q91VT1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nsmce2Q91VT1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nsmce2Q91VT1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nsmce2Q91VT1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Nsmce2Q91VT1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nsmce2Q91VT1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nsmce2Q91VT1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nsmce2Q91VT1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nsmce2Q91VT1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nsmce2Q91VT1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nsmce2Q91VT1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nsmce2Q91VT1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nsmce2Q91VT1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nsmce2Q91VT1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nsmce2Q91VT1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nsmce2Q91VT1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nsmce2Q91VT1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nsmce2Q91VT1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nsmce2Q91VT1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nsmce2Q91VT1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nsmce2Q91VT1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nsmce2Q91VT1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nsmce2Q91VT1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Nsmce2Q91VT1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nsmce2Q91VT1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nsmce2Q91VT1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nsmce2Q91VT1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nsmce2Q91VT1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nsmce2Q91VT1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nsmce2Q91VT1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nsmce2Q91VT1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Nsmce2Q91VT1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nsmce2Q91VT1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nsmce2Q91VT1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nsmce2Q91VT1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nsmce2Q91VT1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nsmce2Q91VT1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nsmce2Q91VT1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nsmce2Q91VT1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nsmce2Q91VT1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nsmce2Q91VT1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nsmce2Q91VT1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nsmce2Q91VT1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nsmce2Q91VT1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Nsmce2Q91VT1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Nsmce2Q91VT1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nsmce2Q91VT1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Nsmce2Q91VT1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nsmce2Q91VT1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nsmce2Q91VT1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nsmce2Q91VT1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nsmce2Q91VT1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Nsmce2Q91VT1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Nsmce2Q91VT1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nsmce2Q91VT1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nsmce2Q91VT1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nsmce2Q91VT1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nsmce2Q91VT1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nsmce2Q91VT1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nsmce2Q91VT1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Nsmce2Q91VT1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nsmce2Q91VT1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms