Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hps3Q91VB4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hps3Q91VB4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hps3Q91VB4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hps3Q91VB4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Hps3Q91VB4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hps3Q91VB4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hps3Q91VB4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hps3Q91VB4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hps3Q91VB4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hps3Q91VB4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hps3Q91VB4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hps3Q91VB4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Hps3Q91VB4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hps3Q91VB4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hps3Q91VB4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hps3Q91VB4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hps3Q91VB4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Hps3Q91VB4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hps3Q91VB4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hps3Q91VB4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hps3Q91VB4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hps3Q91VB4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hps3Q91VB4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hps3Q91VB4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hps3Q91VB4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Hps3Q91VB4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hps3Q91VB4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Hps3Q91VB4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hps3Q91VB4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hps3Q91VB4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hps3Q91VB4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hps3Q91VB4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hps3Q91VB4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hps3Q91VB4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hps3Q91VB4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hps3Q91VB4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hps3Q91VB4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hps3Q91VB4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Hps3Q91VB4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hps3Q91VB4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hps3Q91VB4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Hps3Q91VB4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hps3Q91VB4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hps3Q91VB4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hps3Q91VB4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hps3Q91VB4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hps3Q91VB4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hps3Q91VB4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hps3Q91VB4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hps3Q91VB4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hps3Q91VB4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hps3Q91VB4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hps3Q91VB4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hps3Q91VB4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hps3Q91VB4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hps3Q91VB4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hps3Q91VB4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hps3Q91VB4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Hps3Q91VB4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hps3Q91VB4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hps3Q91VB4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hps3Q91VB4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hps3Q91VB4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hps3Q91VB4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hps3Q91VB4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hps3Q91VB4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hps3Q91VB4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hps3Q91VB4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hps3Q91VB4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hps3Q91VB4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hps3Q91VB4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hps3Q91VB4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hps3Q91VB4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hps3Q91VB4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Hps3Q91VB4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hps3Q91VB4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hps3Q91VB4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Hps3Q91VB4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hps3Q91VB4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hps3Q91VB4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hps3Q91VB4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hps3Q91VB4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hps3Q91VB4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hps3Q91VB4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hps3Q91VB4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hps3Q91VB4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Hps3Q91VB4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Hps3Q91VB4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hps3Q91VB4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hps3Q91VB4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hps3Q91VB4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hps3Q91VB4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hps3Q91VB4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hps3Q91VB4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hps3Q91VB4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hps3Q91VB4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hps3Q91VB4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hps3Q91VB4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Hps3Q91VB4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms