Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smg8Q8VE18 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smg8Q8VE18 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smg8Q8VE18 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smg8Q8VE18 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smg8Q8VE18 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smg8Q8VE18 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Smg8Q8VE18 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Smg8Q8VE18 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Smg8Q8VE18 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Smg8Q8VE18 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smg8Q8VE18 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smg8Q8VE18 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smg8Q8VE18 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smg8Q8VE18 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smg8Q8VE18 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smg8Q8VE18 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smg8Q8VE18 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smg8Q8VE18 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smg8Q8VE18 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smg8Q8VE18 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smg8Q8VE18 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smg8Q8VE18 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smg8Q8VE18 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smg8Q8VE18 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Smg8Q8VE18 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smg8Q8VE18 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smg8Q8VE18 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smg8Q8VE18 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smg8Q8VE18 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smg8Q8VE18 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Smg8Q8VE18 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smg8Q8VE18 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smg8Q8VE18 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smg8Q8VE18 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smg8Q8VE18 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smg8Q8VE18 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smg8Q8VE18 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smg8Q8VE18 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smg8Q8VE18 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Smg8Q8VE18 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smg8Q8VE18 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smg8Q8VE18 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smg8Q8VE18 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smg8Q8VE18 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smg8Q8VE18 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smg8Q8VE18 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smg8Q8VE18 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smg8Q8VE18 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smg8Q8VE18 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smg8Q8VE18 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smg8Q8VE18 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smg8Q8VE18 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smg8Q8VE18 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smg8Q8VE18 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smg8Q8VE18 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smg8Q8VE18 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smg8Q8VE18 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smg8Q8VE18 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Smg8Q8VE18 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smg8Q8VE18 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smg8Q8VE18 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smg8Q8VE18 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smg8Q8VE18 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smg8Q8VE18 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smg8Q8VE18 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smg8Q8VE18 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smg8Q8VE18 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smg8Q8VE18 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smg8Q8VE18 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smg8Q8VE18 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Smg8Q8VE18 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Smg8Q8VE18 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smg8Q8VE18 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Smg8Q8VE18 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smg8Q8VE18 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smg8Q8VE18 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smg8Q8VE18 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smg8Q8VE18 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smg8Q8VE18 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smg8Q8VE18 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smg8Q8VE18 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smg8Q8VE18 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smg8Q8VE18 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smg8Q8VE18 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smg8Q8VE18 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smg8Q8VE18 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smg8Q8VE18 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smg8Q8VE18 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smg8Q8VE18 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smg8Q8VE18 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smg8Q8VE18 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smg8Q8VE18 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smg8Q8VE18 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smg8Q8VE18 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smg8Q8VE18 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smg8Q8VE18 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smg8Q8VE18 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smg8Q8VE18 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smg8Q8VE18 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
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