Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU3

Apol9a, Apol9a protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol9aQ8VDU3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apol9aQ8VDU3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apol9aQ8VDU3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apol9aQ8VDU3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apol9aQ8VDU3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Apol9aQ8VDU3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Apol9aQ8VDU3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Apol9aQ8VDU3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Apol9aQ8VDU3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Apol9aQ8VDU3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Apol9aQ8VDU3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Apol9aQ8VDU3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Apol9aQ8VDU3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Apol9aQ8VDU3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Apol9aQ8VDU3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Apol9aQ8VDU3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Apol9aQ8VDU3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Apol9aQ8VDU3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Apol9aQ8VDU3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Apol9aQ8VDU3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Apol9aQ8VDU3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Apol9aQ8VDU3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Apol9aQ8VDU3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Apol9aQ8VDU3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Apol9aQ8VDU3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Apol9aQ8VDU3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Apol9aQ8VDU3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Apol9aQ8VDU3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apol9aQ8VDU3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apol9aQ8VDU3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apol9aQ8VDU3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apol9aQ8VDU3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apol9aQ8VDU3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Apol9aQ8VDU3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Apol9aQ8VDU3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Apol9aQ8VDU3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Apol9aQ8VDU3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Apol9aQ8VDU3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apol9aQ8VDU3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apol9aQ8VDU3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apol9aQ8VDU3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apol9aQ8VDU3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apol9aQ8VDU3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apol9aQ8VDU3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Apol9aQ8VDU3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Apol9aQ8VDU3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Apol9aQ8VDU3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Apol9aQ8VDU3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Apol9aQ8VDU3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Apol9aQ8VDU3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Apol9aQ8VDU3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Apol9aQ8VDU3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Apol9aQ8VDU3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Apol9aQ8VDU3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Apol9aQ8VDU3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Apol9aQ8VDU3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Apol9aQ8VDU3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Apol9aQ8VDU3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Apol9aQ8VDU3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Apol9aQ8VDU3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Apol9aQ8VDU3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Apol9aQ8VDU3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Apol9aQ8VDU3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Apol9aQ8VDU3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Apol9aQ8VDU3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Apol9aQ8VDU3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Apol9aQ8VDU3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Apol9aQ8VDU3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Apol9aQ8VDU3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Apol9aQ8VDU3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Apol9aQ8VDU3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Apol9aQ8VDU3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Apol9aQ8VDU3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Apol9aQ8VDU3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Apol9aQ8VDU3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Apol9aQ8VDU3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Apol9aQ8VDU3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Apol9aQ8VDU3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Apol9aQ8VDU3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Apol9aQ8VDU3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Apol9aQ8VDU3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Apol9aQ8VDU3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Apol9aQ8VDU3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Apol9aQ8VDU3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Apol9aQ8VDU3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Apol9aQ8VDU3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Apol9aQ8VDU3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Apol9aQ8VDU3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Apol9aQ8VDU3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Apol9aQ8VDU3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Apol9aQ8VDU3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Apol9aQ8VDU3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Apol9aQ8VDU3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Apol9aQ8VDU3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Apol9aQ8VDU3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Apol9aQ8VDU3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Apol9aQ8VDU3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Apol9aQ8VDU3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Apol9aQ8VDU3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Apol9aQ8VDU3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms