Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rprd1aQ8VDS4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rprd1aQ8VDS4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rprd1aQ8VDS4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rprd1aQ8VDS4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rprd1aQ8VDS4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rprd1aQ8VDS4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rprd1aQ8VDS4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rprd1aQ8VDS4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rprd1aQ8VDS4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rprd1aQ8VDS4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rprd1aQ8VDS4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rprd1aQ8VDS4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rprd1aQ8VDS4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rprd1aQ8VDS4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rprd1aQ8VDS4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Rprd1aQ8VDS4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rprd1aQ8VDS4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rprd1aQ8VDS4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rprd1aQ8VDS4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rprd1aQ8VDS4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rprd1aQ8VDS4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rprd1aQ8VDS4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rprd1aQ8VDS4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rprd1aQ8VDS4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rprd1aQ8VDS4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rprd1aQ8VDS4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rprd1aQ8VDS4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rprd1aQ8VDS4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rprd1aQ8VDS4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rprd1aQ8VDS4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rprd1aQ8VDS4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rprd1aQ8VDS4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rprd1aQ8VDS4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rprd1aQ8VDS4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rprd1aQ8VDS4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rprd1aQ8VDS4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rprd1aQ8VDS4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rprd1aQ8VDS4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rprd1aQ8VDS4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rprd1aQ8VDS4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rprd1aQ8VDS4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rprd1aQ8VDS4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rprd1aQ8VDS4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rprd1aQ8VDS4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rprd1aQ8VDS4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rprd1aQ8VDS4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rprd1aQ8VDS4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rprd1aQ8VDS4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rprd1aQ8VDS4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rprd1aQ8VDS4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rprd1aQ8VDS4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rprd1aQ8VDS4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rprd1aQ8VDS4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rprd1aQ8VDS4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rprd1aQ8VDS4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rprd1aQ8VDS4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rprd1aQ8VDS4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rprd1aQ8VDS4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rprd1aQ8VDS4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rprd1aQ8VDS4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rprd1aQ8VDS4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rprd1aQ8VDS4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rprd1aQ8VDS4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rprd1aQ8VDS4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rprd1aQ8VDS4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rprd1aQ8VDS4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rprd1aQ8VDS4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rprd1aQ8VDS4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rprd1aQ8VDS4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rprd1aQ8VDS4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rprd1aQ8VDS4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rprd1aQ8VDS4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rprd1aQ8VDS4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rprd1aQ8VDS4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rprd1aQ8VDS4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rprd1aQ8VDS4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rprd1aQ8VDS4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rprd1aQ8VDS4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rprd1aQ8VDS4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rprd1aQ8VDS4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rprd1aQ8VDS4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rprd1aQ8VDS4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rprd1aQ8VDS4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rprd1aQ8VDS4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rprd1aQ8VDS4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rprd1aQ8VDS4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rprd1aQ8VDS4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rprd1aQ8VDS4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rprd1aQ8VDS4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rprd1aQ8VDS4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rprd1aQ8VDS4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rprd1aQ8VDS4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rprd1aQ8VDS4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rprd1aQ8VDS4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rprd1aQ8VDS4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rprd1aQ8VDS4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms