Protein–RNA interactions for Protein: Q8R349

Cdc16, Cell division cycle protein 16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc16Q8R349 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdc16Q8R349 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdc16Q8R349 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdc16Q8R349 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdc16Q8R349 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdc16Q8R349 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdc16Q8R349 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdc16Q8R349 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdc16Q8R349 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdc16Q8R349 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdc16Q8R349 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdc16Q8R349 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdc16Q8R349 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdc16Q8R349 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdc16Q8R349 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdc16Q8R349 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdc16Q8R349 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdc16Q8R349 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdc16Q8R349 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdc16Q8R349 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdc16Q8R349 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdc16Q8R349 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdc16Q8R349 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdc16Q8R349 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdc16Q8R349 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdc16Q8R349 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdc16Q8R349 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdc16Q8R349 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdc16Q8R349 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdc16Q8R349 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdc16Q8R349 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Cdc16Q8R349 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdc16Q8R349 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdc16Q8R349 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdc16Q8R349 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdc16Q8R349 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdc16Q8R349 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdc16Q8R349 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdc16Q8R349 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdc16Q8R349 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdc16Q8R349 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdc16Q8R349 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdc16Q8R349 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdc16Q8R349 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdc16Q8R349 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdc16Q8R349 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdc16Q8R349 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdc16Q8R349 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdc16Q8R349 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdc16Q8R349 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdc16Q8R349 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdc16Q8R349 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdc16Q8R349 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdc16Q8R349 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdc16Q8R349 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdc16Q8R349 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdc16Q8R349 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdc16Q8R349 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdc16Q8R349 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdc16Q8R349 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdc16Q8R349 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdc16Q8R349 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdc16Q8R349 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdc16Q8R349 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdc16Q8R349 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdc16Q8R349 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdc16Q8R349 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdc16Q8R349 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdc16Q8R349 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdc16Q8R349 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdc16Q8R349 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdc16Q8R349 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdc16Q8R349 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdc16Q8R349 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdc16Q8R349 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdc16Q8R349 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdc16Q8R349 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdc16Q8R349 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdc16Q8R349 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdc16Q8R349 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdc16Q8R349 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdc16Q8R349 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdc16Q8R349 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdc16Q8R349 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdc16Q8R349 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdc16Q8R349 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdc16Q8R349 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdc16Q8R349 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdc16Q8R349 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdc16Q8R349 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdc16Q8R349 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdc16Q8R349 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdc16Q8R349 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdc16Q8R349 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdc16Q8R349 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdc16Q8R349 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdc16Q8R349 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdc16Q8R349 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdc16Q8R349 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdc16Q8R349 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms