Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg10Q8R1P4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg10Q8R1P4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg10Q8R1P4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg10Q8R1P4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg10Q8R1P4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg10Q8R1P4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg10Q8R1P4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg10Q8R1P4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg10Q8R1P4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg10Q8R1P4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg10Q8R1P4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg10Q8R1P4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg10Q8R1P4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg10Q8R1P4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg10Q8R1P4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg10Q8R1P4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg10Q8R1P4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atg10Q8R1P4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atg10Q8R1P4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg10Q8R1P4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg10Q8R1P4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg10Q8R1P4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg10Q8R1P4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg10Q8R1P4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg10Q8R1P4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg10Q8R1P4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg10Q8R1P4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg10Q8R1P4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg10Q8R1P4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg10Q8R1P4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg10Q8R1P4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg10Q8R1P4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg10Q8R1P4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg10Q8R1P4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg10Q8R1P4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg10Q8R1P4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg10Q8R1P4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg10Q8R1P4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg10Q8R1P4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg10Q8R1P4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg10Q8R1P4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg10Q8R1P4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg10Q8R1P4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg10Q8R1P4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg10Q8R1P4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg10Q8R1P4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg10Q8R1P4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg10Q8R1P4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg10Q8R1P4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg10Q8R1P4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg10Q8R1P4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg10Q8R1P4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg10Q8R1P4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg10Q8R1P4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg10Q8R1P4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg10Q8R1P4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg10Q8R1P4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg10Q8R1P4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg10Q8R1P4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg10Q8R1P4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg10Q8R1P4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg10Q8R1P4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg10Q8R1P4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg10Q8R1P4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg10Q8R1P4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg10Q8R1P4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg10Q8R1P4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg10Q8R1P4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg10Q8R1P4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg10Q8R1P4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg10Q8R1P4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg10Q8R1P4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg10Q8R1P4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg10Q8R1P4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg10Q8R1P4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg10Q8R1P4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg10Q8R1P4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg10Q8R1P4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Atg10Q8R1P4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Atg10Q8R1P4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg10Q8R1P4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg10Q8R1P4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg10Q8R1P4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg10Q8R1P4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg10Q8R1P4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg10Q8R1P4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg10Q8R1P4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg10Q8R1P4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg10Q8R1P4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg10Q8R1P4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg10Q8R1P4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg10Q8R1P4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg10Q8R1P4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg10Q8R1P4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg10Q8R1P4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg10Q8R1P4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg10Q8R1P4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg10Q8R1P4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg10Q8R1P4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms