Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0K4

Ccdc137, Coiled-coil domain-containing protein 137, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc137Q8R0K4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc137Q8R0K4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc137Q8R0K4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc137Q8R0K4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc137Q8R0K4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc137Q8R0K4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc137Q8R0K4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc137Q8R0K4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc137Q8R0K4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc137Q8R0K4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc137Q8R0K4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc137Q8R0K4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc137Q8R0K4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc137Q8R0K4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc137Q8R0K4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc137Q8R0K4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc137Q8R0K4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc137Q8R0K4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc137Q8R0K4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc137Q8R0K4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc137Q8R0K4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc137Q8R0K4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc137Q8R0K4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc137Q8R0K4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc137Q8R0K4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc137Q8R0K4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc137Q8R0K4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc137Q8R0K4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc137Q8R0K4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc137Q8R0K4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc137Q8R0K4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc137Q8R0K4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc137Q8R0K4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc137Q8R0K4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc137Q8R0K4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc137Q8R0K4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc137Q8R0K4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc137Q8R0K4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc137Q8R0K4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc137Q8R0K4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc137Q8R0K4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc137Q8R0K4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc137Q8R0K4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc137Q8R0K4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc137Q8R0K4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc137Q8R0K4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc137Q8R0K4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc137Q8R0K4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc137Q8R0K4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc137Q8R0K4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc137Q8R0K4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc137Q8R0K4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc137Q8R0K4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc137Q8R0K4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc137Q8R0K4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc137Q8R0K4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc137Q8R0K4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc137Q8R0K4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc137Q8R0K4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc137Q8R0K4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc137Q8R0K4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc137Q8R0K4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc137Q8R0K4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc137Q8R0K4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc137Q8R0K4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc137Q8R0K4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc137Q8R0K4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc137Q8R0K4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc137Q8R0K4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc137Q8R0K4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc137Q8R0K4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc137Q8R0K4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc137Q8R0K4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc137Q8R0K4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc137Q8R0K4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc137Q8R0K4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc137Q8R0K4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc137Q8R0K4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc137Q8R0K4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc137Q8R0K4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc137Q8R0K4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc137Q8R0K4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc137Q8R0K4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc137Q8R0K4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc137Q8R0K4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc137Q8R0K4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc137Q8R0K4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc137Q8R0K4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc137Q8R0K4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc137Q8R0K4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc137Q8R0K4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc137Q8R0K4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc137Q8R0K4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc137Q8R0K4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc137Q8R0K4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc137Q8R0K4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc137Q8R0K4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc137Q8R0K4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc137Q8R0K4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc137Q8R0K4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms