Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4L4

Pof1b, Protein POF1B, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pof1bQ8K4L4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Pof1bQ8K4L4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Pof1bQ8K4L4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Pof1bQ8K4L4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Pof1bQ8K4L4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pof1bQ8K4L4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pof1bQ8K4L4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pof1bQ8K4L4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pof1bQ8K4L4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Pof1bQ8K4L4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pof1bQ8K4L4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pof1bQ8K4L4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pof1bQ8K4L4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pof1bQ8K4L4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Pof1bQ8K4L4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pof1bQ8K4L4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pof1bQ8K4L4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pof1bQ8K4L4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pof1bQ8K4L4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pof1bQ8K4L4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pof1bQ8K4L4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pof1bQ8K4L4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pof1bQ8K4L4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pof1bQ8K4L4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pof1bQ8K4L4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pof1bQ8K4L4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pof1bQ8K4L4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pof1bQ8K4L4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pof1bQ8K4L4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Pof1bQ8K4L4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pof1bQ8K4L4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pof1bQ8K4L4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pof1bQ8K4L4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pof1bQ8K4L4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pof1bQ8K4L4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pof1bQ8K4L4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pof1bQ8K4L4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Pof1bQ8K4L4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pof1bQ8K4L4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Pof1bQ8K4L4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pof1bQ8K4L4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Pof1bQ8K4L4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pof1bQ8K4L4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pof1bQ8K4L4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pof1bQ8K4L4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pof1bQ8K4L4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Pof1bQ8K4L4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pof1bQ8K4L4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pof1bQ8K4L4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pof1bQ8K4L4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pof1bQ8K4L4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pof1bQ8K4L4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pof1bQ8K4L4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pof1bQ8K4L4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pof1bQ8K4L4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pof1bQ8K4L4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pof1bQ8K4L4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pof1bQ8K4L4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pof1bQ8K4L4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Pof1bQ8K4L4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pof1bQ8K4L4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pof1bQ8K4L4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pof1bQ8K4L4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pof1bQ8K4L4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Pof1bQ8K4L4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pof1bQ8K4L4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pof1bQ8K4L4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pof1bQ8K4L4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pof1bQ8K4L4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pof1bQ8K4L4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pof1bQ8K4L4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pof1bQ8K4L4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pof1bQ8K4L4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pof1bQ8K4L4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pof1bQ8K4L4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pof1bQ8K4L4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pof1bQ8K4L4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pof1bQ8K4L4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pof1bQ8K4L4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pof1bQ8K4L4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pof1bQ8K4L4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pof1bQ8K4L4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pof1bQ8K4L4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pof1bQ8K4L4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pof1bQ8K4L4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pof1bQ8K4L4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pof1bQ8K4L4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pof1bQ8K4L4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pof1bQ8K4L4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pof1bQ8K4L4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pof1bQ8K4L4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pof1bQ8K4L4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pof1bQ8K4L4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Pof1bQ8K4L4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pof1bQ8K4L4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Pof1bQ8K4L4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pof1bQ8K4L4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pof1bQ8K4L4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pof1bQ8K4L4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pof1bQ8K4L4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms