Protein–RNA interactions for Protein: Q8K411

Pitrm1, Presequence protease, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitrm1Q8K411 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pitrm1Q8K411 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pitrm1Q8K411 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pitrm1Q8K411 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pitrm1Q8K411 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pitrm1Q8K411 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pitrm1Q8K411 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Pitrm1Q8K411 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pitrm1Q8K411 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pitrm1Q8K411 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pitrm1Q8K411 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pitrm1Q8K411 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pitrm1Q8K411 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pitrm1Q8K411 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pitrm1Q8K411 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pitrm1Q8K411 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pitrm1Q8K411 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pitrm1Q8K411 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pitrm1Q8K411 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pitrm1Q8K411 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Pitrm1Q8K411 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pitrm1Q8K411 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pitrm1Q8K411 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pitrm1Q8K411 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pitrm1Q8K411 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pitrm1Q8K411 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pitrm1Q8K411 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pitrm1Q8K411 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pitrm1Q8K411 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pitrm1Q8K411 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pitrm1Q8K411 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pitrm1Q8K411 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pitrm1Q8K411 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pitrm1Q8K411 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pitrm1Q8K411 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pitrm1Q8K411 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pitrm1Q8K411 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pitrm1Q8K411 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pitrm1Q8K411 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pitrm1Q8K411 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pitrm1Q8K411 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pitrm1Q8K411 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pitrm1Q8K411 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pitrm1Q8K411 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pitrm1Q8K411 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pitrm1Q8K411 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pitrm1Q8K411 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pitrm1Q8K411 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pitrm1Q8K411 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Pitrm1Q8K411 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pitrm1Q8K411 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pitrm1Q8K411 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Pitrm1Q8K411 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pitrm1Q8K411 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pitrm1Q8K411 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pitrm1Q8K411 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pitrm1Q8K411 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pitrm1Q8K411 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pitrm1Q8K411 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pitrm1Q8K411 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pitrm1Q8K411 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pitrm1Q8K411 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pitrm1Q8K411 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pitrm1Q8K411 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pitrm1Q8K411 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pitrm1Q8K411 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pitrm1Q8K411 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pitrm1Q8K411 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pitrm1Q8K411 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pitrm1Q8K411 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pitrm1Q8K411 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pitrm1Q8K411 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pitrm1Q8K411 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pitrm1Q8K411 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pitrm1Q8K411 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pitrm1Q8K411 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pitrm1Q8K411 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Pitrm1Q8K411 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pitrm1Q8K411 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pitrm1Q8K411 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pitrm1Q8K411 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pitrm1Q8K411 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pitrm1Q8K411 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pitrm1Q8K411 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pitrm1Q8K411 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pitrm1Q8K411 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Pitrm1Q8K411 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Pitrm1Q8K411 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pitrm1Q8K411 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pitrm1Q8K411 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pitrm1Q8K411 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pitrm1Q8K411 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pitrm1Q8K411 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pitrm1Q8K411 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pitrm1Q8K411 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pitrm1Q8K411 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pitrm1Q8K411 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pitrm1Q8K411 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pitrm1Q8K411 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pitrm1Q8K411 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms