Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1H7

Tcp11l2, T-complex protein 11-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcp11l2Q8K1H7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tcp11l2Q8K1H7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tcp11l2Q8K1H7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tcp11l2Q8K1H7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tcp11l2Q8K1H7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tcp11l2Q8K1H7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tcp11l2Q8K1H7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tcp11l2Q8K1H7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tcp11l2Q8K1H7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tcp11l2Q8K1H7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tcp11l2Q8K1H7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tcp11l2Q8K1H7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tcp11l2Q8K1H7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tcp11l2Q8K1H7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tcp11l2Q8K1H7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tcp11l2Q8K1H7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tcp11l2Q8K1H7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tcp11l2Q8K1H7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tcp11l2Q8K1H7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tcp11l2Q8K1H7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tcp11l2Q8K1H7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Tcp11l2Q8K1H7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tcp11l2Q8K1H7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tcp11l2Q8K1H7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tcp11l2Q8K1H7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tcp11l2Q8K1H7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tcp11l2Q8K1H7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tcp11l2Q8K1H7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tcp11l2Q8K1H7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tcp11l2Q8K1H7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tcp11l2Q8K1H7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tcp11l2Q8K1H7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tcp11l2Q8K1H7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tcp11l2Q8K1H7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tcp11l2Q8K1H7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tcp11l2Q8K1H7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tcp11l2Q8K1H7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tcp11l2Q8K1H7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tcp11l2Q8K1H7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tcp11l2Q8K1H7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Tcp11l2Q8K1H7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tcp11l2Q8K1H7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tcp11l2Q8K1H7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Tcp11l2Q8K1H7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tcp11l2Q8K1H7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tcp11l2Q8K1H7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Tcp11l2Q8K1H7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tcp11l2Q8K1H7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tcp11l2Q8K1H7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tcp11l2Q8K1H7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tcp11l2Q8K1H7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tcp11l2Q8K1H7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tcp11l2Q8K1H7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tcp11l2Q8K1H7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tcp11l2Q8K1H7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tcp11l2Q8K1H7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tcp11l2Q8K1H7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tcp11l2Q8K1H7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tcp11l2Q8K1H7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tcp11l2Q8K1H7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tcp11l2Q8K1H7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tcp11l2Q8K1H7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tcp11l2Q8K1H7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tcp11l2Q8K1H7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tcp11l2Q8K1H7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tcp11l2Q8K1H7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tcp11l2Q8K1H7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tcp11l2Q8K1H7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tcp11l2Q8K1H7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tcp11l2Q8K1H7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tcp11l2Q8K1H7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tcp11l2Q8K1H7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tcp11l2Q8K1H7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Tcp11l2Q8K1H7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tcp11l2Q8K1H7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tcp11l2Q8K1H7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tcp11l2Q8K1H7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tcp11l2Q8K1H7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tcp11l2Q8K1H7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tcp11l2Q8K1H7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tcp11l2Q8K1H7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tcp11l2Q8K1H7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tcp11l2Q8K1H7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Tcp11l2Q8K1H7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tcp11l2Q8K1H7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tcp11l2Q8K1H7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tcp11l2Q8K1H7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tcp11l2Q8K1H7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Tcp11l2Q8K1H7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tcp11l2Q8K1H7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tcp11l2Q8K1H7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tcp11l2Q8K1H7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tcp11l2Q8K1H7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tcp11l2Q8K1H7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tcp11l2Q8K1H7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tcp11l2Q8K1H7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tcp11l2Q8K1H7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tcp11l2Q8K1H7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tcp11l2Q8K1H7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tcp11l2Q8K1H7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms