Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc28aQ8CEI3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc28aQ8CEI3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc28aQ8CEI3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc28aQ8CEI3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc28aQ8CEI3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc28aQ8CEI3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc28aQ8CEI3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc28aQ8CEI3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc28aQ8CEI3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc28aQ8CEI3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc28aQ8CEI3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc28aQ8CEI3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc28aQ8CEI3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc28aQ8CEI3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc28aQ8CEI3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc28aQ8CEI3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc28aQ8CEI3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc28aQ8CEI3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc28aQ8CEI3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc28aQ8CEI3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc28aQ8CEI3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc28aQ8CEI3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc28aQ8CEI3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc28aQ8CEI3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc28aQ8CEI3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc28aQ8CEI3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc28aQ8CEI3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc28aQ8CEI3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc28aQ8CEI3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc28aQ8CEI3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc28aQ8CEI3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc28aQ8CEI3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc28aQ8CEI3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc28aQ8CEI3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc28aQ8CEI3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc28aQ8CEI3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc28aQ8CEI3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc28aQ8CEI3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc28aQ8CEI3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc28aQ8CEI3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc28aQ8CEI3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc28aQ8CEI3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc28aQ8CEI3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc28aQ8CEI3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc28aQ8CEI3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc28aQ8CEI3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc28aQ8CEI3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc28aQ8CEI3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc28aQ8CEI3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc28aQ8CEI3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc28aQ8CEI3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc28aQ8CEI3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc28aQ8CEI3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc28aQ8CEI3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc28aQ8CEI3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc28aQ8CEI3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms