Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN1

Uncharacterized protein C3orf20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CDN1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q8CDN1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q8CDN1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q8CDN1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q8CDN1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q8CDN1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q8CDN1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q8CDN1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q8CDN1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Q8CDN1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Q8CDN1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q8CDN1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q8CDN1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q8CDN1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Q8CDN1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q8CDN1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q8CDN1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q8CDN1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q8CDN1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q8CDN1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Q8CDN1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q8CDN1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q8CDN1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Q8CDN1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q8CDN1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q8CDN1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q8CDN1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q8CDN1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q8CDN1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q8CDN1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q8CDN1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q8CDN1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q8CDN1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q8CDN1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q8CDN1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q8CDN1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q8CDN1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q8CDN1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Q8CDN1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q8CDN1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q8CDN1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q8CDN1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q8CDN1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q8CDN1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q8CDN1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q8CDN1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q8CDN1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q8CDN1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q8CDN1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q8CDN1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q8CDN1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q8CDN1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q8CDN1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q8CDN1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q8CDN1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q8CDN1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q8CDN1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q8CDN1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q8CDN1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q8CDN1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q8CDN1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q8CDN1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q8CDN1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q8CDN1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q8CDN1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q8CDN1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q8CDN1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q8CDN1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q8CDN1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q8CDN1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q8CDN1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q8CDN1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Q8CDN1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q8CDN1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q8CDN1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Q8CDN1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q8CDN1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q8CDN1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q8CDN1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q8CDN1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q8CDN1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q8CDN1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q8CDN1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q8CDN1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q8CDN1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q8CDN1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q8CDN1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q8CDN1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q8CDN1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q8CDN1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q8CDN1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q8CDN1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q8CDN1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q8CDN1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q8CDN1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Q8CDN1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q8CDN1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q8CDN1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q8CDN1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q8CDN1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms