Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7E7

Stbd1, Starch-binding domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stbd1Q8C7E7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stbd1Q8C7E7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stbd1Q8C7E7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stbd1Q8C7E7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stbd1Q8C7E7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Stbd1Q8C7E7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stbd1Q8C7E7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stbd1Q8C7E7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stbd1Q8C7E7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stbd1Q8C7E7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Stbd1Q8C7E7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stbd1Q8C7E7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stbd1Q8C7E7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stbd1Q8C7E7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stbd1Q8C7E7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stbd1Q8C7E7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stbd1Q8C7E7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stbd1Q8C7E7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stbd1Q8C7E7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stbd1Q8C7E7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stbd1Q8C7E7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Stbd1Q8C7E7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stbd1Q8C7E7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stbd1Q8C7E7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stbd1Q8C7E7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stbd1Q8C7E7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stbd1Q8C7E7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stbd1Q8C7E7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stbd1Q8C7E7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stbd1Q8C7E7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stbd1Q8C7E7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stbd1Q8C7E7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stbd1Q8C7E7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stbd1Q8C7E7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stbd1Q8C7E7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stbd1Q8C7E7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stbd1Q8C7E7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stbd1Q8C7E7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stbd1Q8C7E7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stbd1Q8C7E7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stbd1Q8C7E7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stbd1Q8C7E7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stbd1Q8C7E7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stbd1Q8C7E7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stbd1Q8C7E7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stbd1Q8C7E7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stbd1Q8C7E7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stbd1Q8C7E7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stbd1Q8C7E7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stbd1Q8C7E7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stbd1Q8C7E7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stbd1Q8C7E7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stbd1Q8C7E7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stbd1Q8C7E7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Stbd1Q8C7E7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stbd1Q8C7E7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stbd1Q8C7E7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stbd1Q8C7E7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stbd1Q8C7E7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stbd1Q8C7E7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stbd1Q8C7E7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stbd1Q8C7E7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stbd1Q8C7E7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stbd1Q8C7E7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stbd1Q8C7E7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stbd1Q8C7E7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stbd1Q8C7E7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stbd1Q8C7E7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stbd1Q8C7E7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stbd1Q8C7E7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stbd1Q8C7E7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Stbd1Q8C7E7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stbd1Q8C7E7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stbd1Q8C7E7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stbd1Q8C7E7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stbd1Q8C7E7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stbd1Q8C7E7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stbd1Q8C7E7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stbd1Q8C7E7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stbd1Q8C7E7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stbd1Q8C7E7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stbd1Q8C7E7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Stbd1Q8C7E7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stbd1Q8C7E7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Stbd1Q8C7E7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Stbd1Q8C7E7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stbd1Q8C7E7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stbd1Q8C7E7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Stbd1Q8C7E7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Stbd1Q8C7E7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stbd1Q8C7E7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Stbd1Q8C7E7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stbd1Q8C7E7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stbd1Q8C7E7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stbd1Q8C7E7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stbd1Q8C7E7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stbd1Q8C7E7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stbd1Q8C7E7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Stbd1Q8C7E7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Stbd1Q8C7E7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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