Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6E1

Apol7c, Apolipoprotein L 7c, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7cQ8C6E1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Apol7cQ8C6E1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Apol7cQ8C6E1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Apol7cQ8C6E1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Apol7cQ8C6E1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Apol7cQ8C6E1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Apol7cQ8C6E1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Apol7cQ8C6E1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Apol7cQ8C6E1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Apol7cQ8C6E1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apol7cQ8C6E1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apol7cQ8C6E1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Apol7cQ8C6E1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Apol7cQ8C6E1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Apol7cQ8C6E1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Apol7cQ8C6E1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Apol7cQ8C6E1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Apol7cQ8C6E1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Apol7cQ8C6E1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Apol7cQ8C6E1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Apol7cQ8C6E1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Apol7cQ8C6E1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Apol7cQ8C6E1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Apol7cQ8C6E1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Apol7cQ8C6E1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Apol7cQ8C6E1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Apol7cQ8C6E1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Apol7cQ8C6E1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apol7cQ8C6E1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apol7cQ8C6E1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Apol7cQ8C6E1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Apol7cQ8C6E1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Apol7cQ8C6E1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Apol7cQ8C6E1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apol7cQ8C6E1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Apol7cQ8C6E1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apol7cQ8C6E1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apol7cQ8C6E1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apol7cQ8C6E1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Apol7cQ8C6E1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Apol7cQ8C6E1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Apol7cQ8C6E1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Apol7cQ8C6E1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Apol7cQ8C6E1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Apol7cQ8C6E1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Apol7cQ8C6E1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Apol7cQ8C6E1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Apol7cQ8C6E1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Apol7cQ8C6E1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Apol7cQ8C6E1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Apol7cQ8C6E1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Apol7cQ8C6E1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Apol7cQ8C6E1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Apol7cQ8C6E1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Apol7cQ8C6E1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Apol7cQ8C6E1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Apol7cQ8C6E1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Apol7cQ8C6E1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Apol7cQ8C6E1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Apol7cQ8C6E1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Apol7cQ8C6E1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Apol7cQ8C6E1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Apol7cQ8C6E1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Apol7cQ8C6E1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Apol7cQ8C6E1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Apol7cQ8C6E1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Apol7cQ8C6E1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Apol7cQ8C6E1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Apol7cQ8C6E1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Apol7cQ8C6E1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Apol7cQ8C6E1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Apol7cQ8C6E1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Apol7cQ8C6E1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Apol7cQ8C6E1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Apol7cQ8C6E1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Apol7cQ8C6E1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Apol7cQ8C6E1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Apol7cQ8C6E1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Apol7cQ8C6E1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Apol7cQ8C6E1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Apol7cQ8C6E1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Apol7cQ8C6E1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Apol7cQ8C6E1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Apol7cQ8C6E1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Apol7cQ8C6E1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Apol7cQ8C6E1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Apol7cQ8C6E1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Apol7cQ8C6E1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Apol7cQ8C6E1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Apol7cQ8C6E1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Apol7cQ8C6E1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Apol7cQ8C6E1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Apol7cQ8C6E1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Apol7cQ8C6E1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Apol7cQ8C6E1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Apol7cQ8C6E1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Apol7cQ8C6E1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Apol7cQ8C6E1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Apol7cQ8C6E1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Apol7cQ8C6E1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms