Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bhlhe22Q8C6A8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bhlhe22Q8C6A8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bhlhe22Q8C6A8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bhlhe22Q8C6A8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bhlhe22Q8C6A8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bhlhe22Q8C6A8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bhlhe22Q8C6A8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bhlhe22Q8C6A8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bhlhe22Q8C6A8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bhlhe22Q8C6A8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bhlhe22Q8C6A8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bhlhe22Q8C6A8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bhlhe22Q8C6A8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bhlhe22Q8C6A8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bhlhe22Q8C6A8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bhlhe22Q8C6A8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bhlhe22Q8C6A8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bhlhe22Q8C6A8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bhlhe22Q8C6A8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bhlhe22Q8C6A8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Bhlhe22Q8C6A8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bhlhe22Q8C6A8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bhlhe22Q8C6A8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Bhlhe22Q8C6A8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Bhlhe22Q8C6A8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bhlhe22Q8C6A8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bhlhe22Q8C6A8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bhlhe22Q8C6A8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bhlhe22Q8C6A8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bhlhe22Q8C6A8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bhlhe22Q8C6A8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Bhlhe22Q8C6A8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bhlhe22Q8C6A8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bhlhe22Q8C6A8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bhlhe22Q8C6A8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bhlhe22Q8C6A8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bhlhe22Q8C6A8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bhlhe22Q8C6A8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bhlhe22Q8C6A8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bhlhe22Q8C6A8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bhlhe22Q8C6A8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bhlhe22Q8C6A8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bhlhe22Q8C6A8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bhlhe22Q8C6A8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bhlhe22Q8C6A8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bhlhe22Q8C6A8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bhlhe22Q8C6A8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bhlhe22Q8C6A8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bhlhe22Q8C6A8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Bhlhe22Q8C6A8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bhlhe22Q8C6A8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Bhlhe22Q8C6A8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bhlhe22Q8C6A8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bhlhe22Q8C6A8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bhlhe22Q8C6A8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Bhlhe22Q8C6A8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bhlhe22Q8C6A8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bhlhe22Q8C6A8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bhlhe22Q8C6A8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bhlhe22Q8C6A8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bhlhe22Q8C6A8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bhlhe22Q8C6A8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bhlhe22Q8C6A8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bhlhe22Q8C6A8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bhlhe22Q8C6A8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bhlhe22Q8C6A8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bhlhe22Q8C6A8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bhlhe22Q8C6A8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bhlhe22Q8C6A8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bhlhe22Q8C6A8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bhlhe22Q8C6A8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bhlhe22Q8C6A8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bhlhe22Q8C6A8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bhlhe22Q8C6A8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bhlhe22Q8C6A8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bhlhe22Q8C6A8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Bhlhe22Q8C6A8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bhlhe22Q8C6A8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bhlhe22Q8C6A8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bhlhe22Q8C6A8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bhlhe22Q8C6A8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bhlhe22Q8C6A8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bhlhe22Q8C6A8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bhlhe22Q8C6A8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bhlhe22Q8C6A8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bhlhe22Q8C6A8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bhlhe22Q8C6A8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bhlhe22Q8C6A8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bhlhe22Q8C6A8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bhlhe22Q8C6A8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bhlhe22Q8C6A8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bhlhe22Q8C6A8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bhlhe22Q8C6A8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bhlhe22Q8C6A8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bhlhe22Q8C6A8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bhlhe22Q8C6A8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bhlhe22Q8C6A8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bhlhe22Q8C6A8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bhlhe22Q8C6A8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.8 ms