Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cnot2Q8C5L3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cnot2Q8C5L3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnot2Q8C5L3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnot2Q8C5L3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnot2Q8C5L3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnot2Q8C5L3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnot2Q8C5L3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnot2Q8C5L3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnot2Q8C5L3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnot2Q8C5L3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnot2Q8C5L3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnot2Q8C5L3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnot2Q8C5L3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnot2Q8C5L3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnot2Q8C5L3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnot2Q8C5L3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnot2Q8C5L3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnot2Q8C5L3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnot2Q8C5L3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnot2Q8C5L3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnot2Q8C5L3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnot2Q8C5L3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnot2Q8C5L3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cnot2Q8C5L3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cnot2Q8C5L3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cnot2Q8C5L3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnot2Q8C5L3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnot2Q8C5L3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnot2Q8C5L3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnot2Q8C5L3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnot2Q8C5L3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnot2Q8C5L3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnot2Q8C5L3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnot2Q8C5L3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnot2Q8C5L3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnot2Q8C5L3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnot2Q8C5L3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnot2Q8C5L3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnot2Q8C5L3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnot2Q8C5L3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnot2Q8C5L3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnot2Q8C5L3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnot2Q8C5L3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnot2Q8C5L3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnot2Q8C5L3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnot2Q8C5L3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnot2Q8C5L3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnot2Q8C5L3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnot2Q8C5L3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnot2Q8C5L3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnot2Q8C5L3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cnot2Q8C5L3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnot2Q8C5L3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnot2Q8C5L3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnot2Q8C5L3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnot2Q8C5L3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnot2Q8C5L3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnot2Q8C5L3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnot2Q8C5L3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnot2Q8C5L3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnot2Q8C5L3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnot2Q8C5L3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnot2Q8C5L3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnot2Q8C5L3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnot2Q8C5L3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnot2Q8C5L3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnot2Q8C5L3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnot2Q8C5L3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnot2Q8C5L3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnot2Q8C5L3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnot2Q8C5L3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnot2Q8C5L3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnot2Q8C5L3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnot2Q8C5L3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnot2Q8C5L3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnot2Q8C5L3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnot2Q8C5L3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnot2Q8C5L3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnot2Q8C5L3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cnot2Q8C5L3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cnot2Q8C5L3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Cnot2Q8C5L3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cnot2Q8C5L3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cnot2Q8C5L3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cnot2Q8C5L3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnot2Q8C5L3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnot2Q8C5L3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnot2Q8C5L3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnot2Q8C5L3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnot2Q8C5L3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cnot2Q8C5L3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cnot2Q8C5L3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cnot2Q8C5L3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Cnot2Q8C5L3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cnot2Q8C5L3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cnot2Q8C5L3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Cnot2Q8C5L3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cnot2Q8C5L3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cnot2Q8C5L3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms