Protein–RNA interactions for Protein: Q8C428

Tmc7, Transmembrane channel-like protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmc7Q8C428 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmc7Q8C428 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmc7Q8C428 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmc7Q8C428 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmc7Q8C428 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmc7Q8C428 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmc7Q8C428 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmc7Q8C428 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmc7Q8C428 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmc7Q8C428 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmc7Q8C428 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmc7Q8C428 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmc7Q8C428 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmc7Q8C428 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmc7Q8C428 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmc7Q8C428 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmc7Q8C428 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmc7Q8C428 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmc7Q8C428 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmc7Q8C428 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmc7Q8C428 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmc7Q8C428 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmc7Q8C428 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmc7Q8C428 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmc7Q8C428 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmc7Q8C428 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmc7Q8C428 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmc7Q8C428 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmc7Q8C428 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmc7Q8C428 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmc7Q8C428 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmc7Q8C428 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmc7Q8C428 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmc7Q8C428 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmc7Q8C428 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmc7Q8C428 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmc7Q8C428 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmc7Q8C428 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmc7Q8C428 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmc7Q8C428 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmc7Q8C428 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmc7Q8C428 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmc7Q8C428 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmc7Q8C428 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmc7Q8C428 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmc7Q8C428 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmc7Q8C428 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmc7Q8C428 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tmc7Q8C428 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmc7Q8C428 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmc7Q8C428 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmc7Q8C428 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmc7Q8C428 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmc7Q8C428 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmc7Q8C428 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmc7Q8C428 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmc7Q8C428 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmc7Q8C428 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmc7Q8C428 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmc7Q8C428 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmc7Q8C428 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmc7Q8C428 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmc7Q8C428 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmc7Q8C428 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmc7Q8C428 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmc7Q8C428 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmc7Q8C428 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmc7Q8C428 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmc7Q8C428 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmc7Q8C428 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmc7Q8C428 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmc7Q8C428 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmc7Q8C428 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmc7Q8C428 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmc7Q8C428 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmc7Q8C428 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmc7Q8C428 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmc7Q8C428 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmc7Q8C428 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmc7Q8C428 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmc7Q8C428 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmc7Q8C428 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmc7Q8C428 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmc7Q8C428 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmc7Q8C428 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmc7Q8C428 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmc7Q8C428 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmc7Q8C428 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmc7Q8C428 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmc7Q8C428 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmc7Q8C428 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmc7Q8C428 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmc7Q8C428 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmc7Q8C428 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmc7Q8C428 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmc7Q8C428 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmc7Q8C428 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmc7Q8C428 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmc7Q8C428 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmc7Q8C428 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms