Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc90bQ8C3X2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc90bQ8C3X2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc90bQ8C3X2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc90bQ8C3X2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc90bQ8C3X2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc90bQ8C3X2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc90bQ8C3X2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc90bQ8C3X2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc90bQ8C3X2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc90bQ8C3X2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc90bQ8C3X2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc90bQ8C3X2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc90bQ8C3X2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc90bQ8C3X2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc90bQ8C3X2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc90bQ8C3X2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc90bQ8C3X2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc90bQ8C3X2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc90bQ8C3X2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc90bQ8C3X2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc90bQ8C3X2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc90bQ8C3X2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc90bQ8C3X2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc90bQ8C3X2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc90bQ8C3X2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc90bQ8C3X2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc90bQ8C3X2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc90bQ8C3X2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc90bQ8C3X2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc90bQ8C3X2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc90bQ8C3X2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc90bQ8C3X2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc90bQ8C3X2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc90bQ8C3X2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc90bQ8C3X2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc90bQ8C3X2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc90bQ8C3X2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc90bQ8C3X2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc90bQ8C3X2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc90bQ8C3X2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc90bQ8C3X2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc90bQ8C3X2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc90bQ8C3X2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc90bQ8C3X2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc90bQ8C3X2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc90bQ8C3X2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc90bQ8C3X2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc90bQ8C3X2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc90bQ8C3X2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc90bQ8C3X2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc90bQ8C3X2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc90bQ8C3X2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc90bQ8C3X2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc90bQ8C3X2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc90bQ8C3X2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc90bQ8C3X2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc90bQ8C3X2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc90bQ8C3X2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc90bQ8C3X2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc90bQ8C3X2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc90bQ8C3X2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc90bQ8C3X2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc90bQ8C3X2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc90bQ8C3X2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc90bQ8C3X2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc90bQ8C3X2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc90bQ8C3X2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc90bQ8C3X2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc90bQ8C3X2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc90bQ8C3X2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc90bQ8C3X2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc90bQ8C3X2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc90bQ8C3X2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc90bQ8C3X2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc90bQ8C3X2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc90bQ8C3X2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc90bQ8C3X2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc90bQ8C3X2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc90bQ8C3X2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc90bQ8C3X2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc90bQ8C3X2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc90bQ8C3X2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc90bQ8C3X2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc90bQ8C3X2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc90bQ8C3X2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc90bQ8C3X2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc90bQ8C3X2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc90bQ8C3X2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc90bQ8C3X2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc90bQ8C3X2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc90bQ8C3X2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc90bQ8C3X2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc90bQ8C3X2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc90bQ8C3X2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc90bQ8C3X2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc90bQ8C3X2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.6 ms