Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3F7

Klhl30, Kelch-like protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl30Q8C3F7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Klhl30Q8C3F7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Klhl30Q8C3F7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Klhl30Q8C3F7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Klhl30Q8C3F7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Klhl30Q8C3F7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Klhl30Q8C3F7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Klhl30Q8C3F7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Klhl30Q8C3F7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Klhl30Q8C3F7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Klhl30Q8C3F7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Klhl30Q8C3F7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Klhl30Q8C3F7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Klhl30Q8C3F7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Klhl30Q8C3F7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Klhl30Q8C3F7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Klhl30Q8C3F7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Klhl30Q8C3F7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Klhl30Q8C3F7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Klhl30Q8C3F7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Klhl30Q8C3F7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Klhl30Q8C3F7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Klhl30Q8C3F7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Klhl30Q8C3F7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Klhl30Q8C3F7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Klhl30Q8C3F7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Klhl30Q8C3F7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Klhl30Q8C3F7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Klhl30Q8C3F7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Klhl30Q8C3F7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Klhl30Q8C3F7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Klhl30Q8C3F7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Klhl30Q8C3F7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Klhl30Q8C3F7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Klhl30Q8C3F7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Klhl30Q8C3F7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Klhl30Q8C3F7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Klhl30Q8C3F7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Klhl30Q8C3F7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Klhl30Q8C3F7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Klhl30Q8C3F7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Klhl30Q8C3F7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Klhl30Q8C3F7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Klhl30Q8C3F7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Klhl30Q8C3F7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Klhl30Q8C3F7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Klhl30Q8C3F7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Klhl30Q8C3F7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Klhl30Q8C3F7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Klhl30Q8C3F7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Klhl30Q8C3F7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Klhl30Q8C3F7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Klhl30Q8C3F7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Klhl30Q8C3F7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Klhl30Q8C3F7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Klhl30Q8C3F7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Klhl30Q8C3F7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Klhl30Q8C3F7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Klhl30Q8C3F7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Klhl30Q8C3F7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Klhl30Q8C3F7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Klhl30Q8C3F7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Klhl30Q8C3F7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Klhl30Q8C3F7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Klhl30Q8C3F7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Klhl30Q8C3F7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Klhl30Q8C3F7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Klhl30Q8C3F7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Klhl30Q8C3F7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Klhl30Q8C3F7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Klhl30Q8C3F7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Klhl30Q8C3F7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Klhl30Q8C3F7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Klhl30Q8C3F7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Klhl30Q8C3F7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Klhl30Q8C3F7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Klhl30Q8C3F7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Klhl30Q8C3F7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Klhl30Q8C3F7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Klhl30Q8C3F7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Klhl30Q8C3F7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Klhl30Q8C3F7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Klhl30Q8C3F7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Klhl30Q8C3F7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Klhl30Q8C3F7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Klhl30Q8C3F7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Klhl30Q8C3F7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Klhl30Q8C3F7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Klhl30Q8C3F7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Klhl30Q8C3F7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Klhl30Q8C3F7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Klhl30Q8C3F7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Klhl30Q8C3F7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Klhl30Q8C3F7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Klhl30Q8C3F7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Klhl30Q8C3F7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Klhl30Q8C3F7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Klhl30Q8C3F7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Klhl30Q8C3F7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Klhl30Q8C3F7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms