Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim35Q8C006 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim35Q8C006 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim35Q8C006 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim35Q8C006 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trim35Q8C006 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim35Q8C006 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim35Q8C006 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim35Q8C006 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim35Q8C006 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim35Q8C006 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim35Q8C006 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim35Q8C006 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim35Q8C006 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim35Q8C006 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim35Q8C006 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim35Q8C006 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim35Q8C006 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim35Q8C006 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim35Q8C006 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim35Q8C006 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim35Q8C006 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim35Q8C006 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim35Q8C006 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim35Q8C006 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim35Q8C006 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim35Q8C006 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim35Q8C006 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim35Q8C006 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim35Q8C006 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim35Q8C006 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim35Q8C006 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim35Q8C006 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim35Q8C006 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim35Q8C006 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim35Q8C006 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim35Q8C006 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim35Q8C006 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim35Q8C006 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Trim35Q8C006 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim35Q8C006 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim35Q8C006 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim35Q8C006 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim35Q8C006 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim35Q8C006 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim35Q8C006 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim35Q8C006 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim35Q8C006 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim35Q8C006 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim35Q8C006 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim35Q8C006 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim35Q8C006 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim35Q8C006 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim35Q8C006 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim35Q8C006 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim35Q8C006 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim35Q8C006 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim35Q8C006 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim35Q8C006 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim35Q8C006 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim35Q8C006 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim35Q8C006 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim35Q8C006 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim35Q8C006 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim35Q8C006 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim35Q8C006 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim35Q8C006 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim35Q8C006 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim35Q8C006 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim35Q8C006 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim35Q8C006 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim35Q8C006 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim35Q8C006 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim35Q8C006 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim35Q8C006 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim35Q8C006 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim35Q8C006 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Trim35Q8C006 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim35Q8C006 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim35Q8C006 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim35Q8C006 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim35Q8C006 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim35Q8C006 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim35Q8C006 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim35Q8C006 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim35Q8C006 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim35Q8C006 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim35Q8C006 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim35Q8C006 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim35Q8C006 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim35Q8C006 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim35Q8C006 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim35Q8C006 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim35Q8C006 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim35Q8C006 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim35Q8C006 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim35Q8C006 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim35Q8C006 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim35Q8C006 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim35Q8C006 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
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