Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL9

Iffo1, Intermediate filament family orphan 1, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo1Q8BXL9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Iffo1Q8BXL9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Iffo1Q8BXL9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Iffo1Q8BXL9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Iffo1Q8BXL9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Iffo1Q8BXL9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Iffo1Q8BXL9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Iffo1Q8BXL9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Iffo1Q8BXL9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Iffo1Q8BXL9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Iffo1Q8BXL9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Iffo1Q8BXL9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Iffo1Q8BXL9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Iffo1Q8BXL9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Iffo1Q8BXL9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Iffo1Q8BXL9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Iffo1Q8BXL9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Iffo1Q8BXL9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Iffo1Q8BXL9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Iffo1Q8BXL9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Iffo1Q8BXL9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Iffo1Q8BXL9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Iffo1Q8BXL9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Iffo1Q8BXL9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Iffo1Q8BXL9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Iffo1Q8BXL9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Iffo1Q8BXL9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Iffo1Q8BXL9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Iffo1Q8BXL9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Iffo1Q8BXL9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Iffo1Q8BXL9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Iffo1Q8BXL9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Iffo1Q8BXL9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Iffo1Q8BXL9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Iffo1Q8BXL9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Iffo1Q8BXL9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Iffo1Q8BXL9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Iffo1Q8BXL9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Iffo1Q8BXL9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Iffo1Q8BXL9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Iffo1Q8BXL9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Iffo1Q8BXL9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Iffo1Q8BXL9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Iffo1Q8BXL9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Iffo1Q8BXL9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Iffo1Q8BXL9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Iffo1Q8BXL9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Iffo1Q8BXL9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Iffo1Q8BXL9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Iffo1Q8BXL9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Iffo1Q8BXL9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Iffo1Q8BXL9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Iffo1Q8BXL9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Iffo1Q8BXL9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Iffo1Q8BXL9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Iffo1Q8BXL9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Iffo1Q8BXL9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Iffo1Q8BXL9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Iffo1Q8BXL9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Iffo1Q8BXL9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Iffo1Q8BXL9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Iffo1Q8BXL9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Iffo1Q8BXL9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Iffo1Q8BXL9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Iffo1Q8BXL9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Iffo1Q8BXL9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Iffo1Q8BXL9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Iffo1Q8BXL9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Iffo1Q8BXL9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Iffo1Q8BXL9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Iffo1Q8BXL9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Iffo1Q8BXL9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Iffo1Q8BXL9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Iffo1Q8BXL9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Iffo1Q8BXL9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Iffo1Q8BXL9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Iffo1Q8BXL9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Iffo1Q8BXL9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Iffo1Q8BXL9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Iffo1Q8BXL9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Iffo1Q8BXL9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Iffo1Q8BXL9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Iffo1Q8BXL9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Iffo1Q8BXL9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Iffo1Q8BXL9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Iffo1Q8BXL9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Iffo1Q8BXL9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Iffo1Q8BXL9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Iffo1Q8BXL9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Iffo1Q8BXL9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Iffo1Q8BXL9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Iffo1Q8BXL9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Iffo1Q8BXL9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Iffo1Q8BXL9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Iffo1Q8BXL9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Iffo1Q8BXL9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Iffo1Q8BXL9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Iffo1Q8BXL9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Iffo1Q8BXL9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Iffo1Q8BXL9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms