Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ctdsp2Q8BX07 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ctdsp2Q8BX07 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ctdsp2Q8BX07 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ctdsp2Q8BX07 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ctdsp2Q8BX07 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ctdsp2Q8BX07 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ctdsp2Q8BX07 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ctdsp2Q8BX07 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctdsp2Q8BX07 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctdsp2Q8BX07 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctdsp2Q8BX07 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctdsp2Q8BX07 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctdsp2Q8BX07 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctdsp2Q8BX07 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctdsp2Q8BX07 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctdsp2Q8BX07 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctdsp2Q8BX07 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctdsp2Q8BX07 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctdsp2Q8BX07 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctdsp2Q8BX07 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctdsp2Q8BX07 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctdsp2Q8BX07 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctdsp2Q8BX07 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctdsp2Q8BX07 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctdsp2Q8BX07 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ctdsp2Q8BX07 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ctdsp2Q8BX07 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ctdsp2Q8BX07 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctdsp2Q8BX07 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctdsp2Q8BX07 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctdsp2Q8BX07 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctdsp2Q8BX07 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctdsp2Q8BX07 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctdsp2Q8BX07 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctdsp2Q8BX07 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctdsp2Q8BX07 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctdsp2Q8BX07 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctdsp2Q8BX07 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctdsp2Q8BX07 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctdsp2Q8BX07 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctdsp2Q8BX07 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctdsp2Q8BX07 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctdsp2Q8BX07 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctdsp2Q8BX07 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctdsp2Q8BX07 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctdsp2Q8BX07 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctdsp2Q8BX07 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctdsp2Q8BX07 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctdsp2Q8BX07 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctdsp2Q8BX07 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctdsp2Q8BX07 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctdsp2Q8BX07 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctdsp2Q8BX07 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctdsp2Q8BX07 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctdsp2Q8BX07 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctdsp2Q8BX07 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctdsp2Q8BX07 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctdsp2Q8BX07 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctdsp2Q8BX07 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctdsp2Q8BX07 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctdsp2Q8BX07 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctdsp2Q8BX07 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctdsp2Q8BX07 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctdsp2Q8BX07 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctdsp2Q8BX07 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctdsp2Q8BX07 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctdsp2Q8BX07 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctdsp2Q8BX07 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctdsp2Q8BX07 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctdsp2Q8BX07 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ctdsp2Q8BX07 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ctdsp2Q8BX07 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctdsp2Q8BX07 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctdsp2Q8BX07 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctdsp2Q8BX07 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctdsp2Q8BX07 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ctdsp2Q8BX07 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ctdsp2Q8BX07 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ctdsp2Q8BX07 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ctdsp2Q8BX07 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ctdsp2Q8BX07 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ctdsp2Q8BX07 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ctdsp2Q8BX07 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ctdsp2Q8BX07 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ctdsp2Q8BX07 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ctdsp2Q8BX07 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ctdsp2Q8BX07 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ctdsp2Q8BX07 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ctdsp2Q8BX07 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ctdsp2Q8BX07 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ctdsp2Q8BX07 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ctdsp2Q8BX07 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ctdsp2Q8BX07 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ctdsp2Q8BX07 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ctdsp2Q8BX07 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ctdsp2Q8BX07 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ctdsp2Q8BX07 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ctdsp2Q8BX07 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ctdsp2Q8BX07 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms