Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSF5

Klhl38, Kelch-like protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl38Q8BSF5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klhl38Q8BSF5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klhl38Q8BSF5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klhl38Q8BSF5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klhl38Q8BSF5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klhl38Q8BSF5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klhl38Q8BSF5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klhl38Q8BSF5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klhl38Q8BSF5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klhl38Q8BSF5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klhl38Q8BSF5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klhl38Q8BSF5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klhl38Q8BSF5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klhl38Q8BSF5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klhl38Q8BSF5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klhl38Q8BSF5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klhl38Q8BSF5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klhl38Q8BSF5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klhl38Q8BSF5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klhl38Q8BSF5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klhl38Q8BSF5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klhl38Q8BSF5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klhl38Q8BSF5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klhl38Q8BSF5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klhl38Q8BSF5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klhl38Q8BSF5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klhl38Q8BSF5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klhl38Q8BSF5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klhl38Q8BSF5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Klhl38Q8BSF5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Klhl38Q8BSF5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Klhl38Q8BSF5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klhl38Q8BSF5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klhl38Q8BSF5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klhl38Q8BSF5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klhl38Q8BSF5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klhl38Q8BSF5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klhl38Q8BSF5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klhl38Q8BSF5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klhl38Q8BSF5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klhl38Q8BSF5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klhl38Q8BSF5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klhl38Q8BSF5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klhl38Q8BSF5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klhl38Q8BSF5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klhl38Q8BSF5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klhl38Q8BSF5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klhl38Q8BSF5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klhl38Q8BSF5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klhl38Q8BSF5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Klhl38Q8BSF5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klhl38Q8BSF5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klhl38Q8BSF5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klhl38Q8BSF5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klhl38Q8BSF5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klhl38Q8BSF5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klhl38Q8BSF5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klhl38Q8BSF5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klhl38Q8BSF5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klhl38Q8BSF5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klhl38Q8BSF5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klhl38Q8BSF5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klhl38Q8BSF5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klhl38Q8BSF5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klhl38Q8BSF5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klhl38Q8BSF5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Klhl38Q8BSF5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Klhl38Q8BSF5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klhl38Q8BSF5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klhl38Q8BSF5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klhl38Q8BSF5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klhl38Q8BSF5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klhl38Q8BSF5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Klhl38Q8BSF5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Klhl38Q8BSF5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Klhl38Q8BSF5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Klhl38Q8BSF5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Klhl38Q8BSF5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klhl38Q8BSF5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klhl38Q8BSF5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Klhl38Q8BSF5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klhl38Q8BSF5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klhl38Q8BSF5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klhl38Q8BSF5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klhl38Q8BSF5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klhl38Q8BSF5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klhl38Q8BSF5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Klhl38Q8BSF5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klhl38Q8BSF5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klhl38Q8BSF5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klhl38Q8BSF5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klhl38Q8BSF5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klhl38Q8BSF5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klhl38Q8BSF5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klhl38Q8BSF5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klhl38Q8BSF5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klhl38Q8BSF5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Klhl38Q8BSF5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klhl38Q8BSF5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Klhl38Q8BSF5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms