Protein–RNA interactions for Protein: Q8BNV8

A530064D06Rik, Plasmacytoid dendritic cell-specific receptor, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A530064D06RikQ8BNV8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A530064D06RikQ8BNV8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A530064D06RikQ8BNV8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A530064D06RikQ8BNV8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A530064D06RikQ8BNV8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A530064D06RikQ8BNV8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A530064D06RikQ8BNV8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A530064D06RikQ8BNV8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A530064D06RikQ8BNV8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A530064D06RikQ8BNV8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A530064D06RikQ8BNV8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A530064D06RikQ8BNV8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A530064D06RikQ8BNV8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A530064D06RikQ8BNV8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A530064D06RikQ8BNV8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
A530064D06RikQ8BNV8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A530064D06RikQ8BNV8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A530064D06RikQ8BNV8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
A530064D06RikQ8BNV8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A530064D06RikQ8BNV8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A530064D06RikQ8BNV8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A530064D06RikQ8BNV8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A530064D06RikQ8BNV8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A530064D06RikQ8BNV8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A530064D06RikQ8BNV8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A530064D06RikQ8BNV8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A530064D06RikQ8BNV8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A530064D06RikQ8BNV8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A530064D06RikQ8BNV8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A530064D06RikQ8BNV8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A530064D06RikQ8BNV8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A530064D06RikQ8BNV8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
A530064D06RikQ8BNV8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A530064D06RikQ8BNV8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A530064D06RikQ8BNV8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
A530064D06RikQ8BNV8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
A530064D06RikQ8BNV8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
A530064D06RikQ8BNV8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A530064D06RikQ8BNV8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A530064D06RikQ8BNV8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A530064D06RikQ8BNV8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A530064D06RikQ8BNV8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A530064D06RikQ8BNV8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A530064D06RikQ8BNV8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A530064D06RikQ8BNV8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A530064D06RikQ8BNV8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A530064D06RikQ8BNV8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A530064D06RikQ8BNV8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A530064D06RikQ8BNV8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A530064D06RikQ8BNV8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A530064D06RikQ8BNV8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A530064D06RikQ8BNV8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A530064D06RikQ8BNV8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A530064D06RikQ8BNV8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A530064D06RikQ8BNV8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A530064D06RikQ8BNV8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A530064D06RikQ8BNV8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A530064D06RikQ8BNV8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A530064D06RikQ8BNV8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A530064D06RikQ8BNV8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A530064D06RikQ8BNV8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
A530064D06RikQ8BNV8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
A530064D06RikQ8BNV8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
A530064D06RikQ8BNV8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A530064D06RikQ8BNV8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A530064D06RikQ8BNV8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A530064D06RikQ8BNV8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
A530064D06RikQ8BNV8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A530064D06RikQ8BNV8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A530064D06RikQ8BNV8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
A530064D06RikQ8BNV8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A530064D06RikQ8BNV8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A530064D06RikQ8BNV8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A530064D06RikQ8BNV8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A530064D06RikQ8BNV8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
A530064D06RikQ8BNV8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A530064D06RikQ8BNV8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A530064D06RikQ8BNV8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A530064D06RikQ8BNV8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
A530064D06RikQ8BNV8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A530064D06RikQ8BNV8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A530064D06RikQ8BNV8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A530064D06RikQ8BNV8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A530064D06RikQ8BNV8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A530064D06RikQ8BNV8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A530064D06RikQ8BNV8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A530064D06RikQ8BNV8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A530064D06RikQ8BNV8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A530064D06RikQ8BNV8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A530064D06RikQ8BNV8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A530064D06RikQ8BNV8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A530064D06RikQ8BNV8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A530064D06RikQ8BNV8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A530064D06RikQ8BNV8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A530064D06RikQ8BNV8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A530064D06RikQ8BNV8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A530064D06RikQ8BNV8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A530064D06RikQ8BNV8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A530064D06RikQ8BNV8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
A530064D06RikQ8BNV8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms