Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJX2

6820408C15Rik, RIKEN cDNA 6820408C15, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6820408C15RikQ8BJX2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
6820408C15RikQ8BJX2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
6820408C15RikQ8BJX2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
6820408C15RikQ8BJX2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
6820408C15RikQ8BJX2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
6820408C15RikQ8BJX2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
6820408C15RikQ8BJX2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
6820408C15RikQ8BJX2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
6820408C15RikQ8BJX2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
6820408C15RikQ8BJX2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
6820408C15RikQ8BJX2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
6820408C15RikQ8BJX2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
6820408C15RikQ8BJX2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
6820408C15RikQ8BJX2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
6820408C15RikQ8BJX2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
6820408C15RikQ8BJX2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
6820408C15RikQ8BJX2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
6820408C15RikQ8BJX2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
6820408C15RikQ8BJX2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
6820408C15RikQ8BJX2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
6820408C15RikQ8BJX2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
6820408C15RikQ8BJX2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
6820408C15RikQ8BJX2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
6820408C15RikQ8BJX2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
6820408C15RikQ8BJX2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
6820408C15RikQ8BJX2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
6820408C15RikQ8BJX2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
6820408C15RikQ8BJX2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
6820408C15RikQ8BJX2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
6820408C15RikQ8BJX2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
6820408C15RikQ8BJX2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
6820408C15RikQ8BJX2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
6820408C15RikQ8BJX2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
6820408C15RikQ8BJX2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
6820408C15RikQ8BJX2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
6820408C15RikQ8BJX2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
6820408C15RikQ8BJX2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
6820408C15RikQ8BJX2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
6820408C15RikQ8BJX2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
6820408C15RikQ8BJX2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
6820408C15RikQ8BJX2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
6820408C15RikQ8BJX2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
6820408C15RikQ8BJX2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
6820408C15RikQ8BJX2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
6820408C15RikQ8BJX2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
6820408C15RikQ8BJX2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
6820408C15RikQ8BJX2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
6820408C15RikQ8BJX2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
6820408C15RikQ8BJX2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
6820408C15RikQ8BJX2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
6820408C15RikQ8BJX2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
6820408C15RikQ8BJX2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
6820408C15RikQ8BJX2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
6820408C15RikQ8BJX2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
6820408C15RikQ8BJX2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
6820408C15RikQ8BJX2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
6820408C15RikQ8BJX2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
6820408C15RikQ8BJX2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
6820408C15RikQ8BJX2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
6820408C15RikQ8BJX2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
6820408C15RikQ8BJX2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
6820408C15RikQ8BJX2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
6820408C15RikQ8BJX2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
6820408C15RikQ8BJX2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
6820408C15RikQ8BJX2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
6820408C15RikQ8BJX2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
6820408C15RikQ8BJX2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
6820408C15RikQ8BJX2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
6820408C15RikQ8BJX2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
6820408C15RikQ8BJX2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
6820408C15RikQ8BJX2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
6820408C15RikQ8BJX2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
6820408C15RikQ8BJX2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
6820408C15RikQ8BJX2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
6820408C15RikQ8BJX2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
6820408C15RikQ8BJX2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
6820408C15RikQ8BJX2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
6820408C15RikQ8BJX2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
6820408C15RikQ8BJX2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
6820408C15RikQ8BJX2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
6820408C15RikQ8BJX2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
6820408C15RikQ8BJX2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
6820408C15RikQ8BJX2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
6820408C15RikQ8BJX2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
6820408C15RikQ8BJX2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
6820408C15RikQ8BJX2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
6820408C15RikQ8BJX2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
6820408C15RikQ8BJX2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
6820408C15RikQ8BJX2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
6820408C15RikQ8BJX2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
6820408C15RikQ8BJX2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
6820408C15RikQ8BJX2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
6820408C15RikQ8BJX2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
6820408C15RikQ8BJX2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
6820408C15RikQ8BJX2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
6820408C15RikQ8BJX2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
6820408C15RikQ8BJX2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
6820408C15RikQ8BJX2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
6820408C15RikQ8BJX2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
6820408C15RikQ8BJX2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms