Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cdca8Q8BHX3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cdca8Q8BHX3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cdca8Q8BHX3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cdca8Q8BHX3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cdca8Q8BHX3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cdca8Q8BHX3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdca8Q8BHX3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdca8Q8BHX3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdca8Q8BHX3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdca8Q8BHX3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdca8Q8BHX3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdca8Q8BHX3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdca8Q8BHX3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdca8Q8BHX3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdca8Q8BHX3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdca8Q8BHX3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdca8Q8BHX3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdca8Q8BHX3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdca8Q8BHX3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdca8Q8BHX3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdca8Q8BHX3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdca8Q8BHX3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdca8Q8BHX3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdca8Q8BHX3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdca8Q8BHX3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdca8Q8BHX3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdca8Q8BHX3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdca8Q8BHX3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdca8Q8BHX3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cdca8Q8BHX3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cdca8Q8BHX3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cdca8Q8BHX3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cdca8Q8BHX3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Cdca8Q8BHX3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Cdca8Q8BHX3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdca8Q8BHX3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdca8Q8BHX3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdca8Q8BHX3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdca8Q8BHX3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdca8Q8BHX3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdca8Q8BHX3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdca8Q8BHX3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdca8Q8BHX3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdca8Q8BHX3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdca8Q8BHX3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdca8Q8BHX3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdca8Q8BHX3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdca8Q8BHX3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdca8Q8BHX3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdca8Q8BHX3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdca8Q8BHX3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdca8Q8BHX3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdca8Q8BHX3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdca8Q8BHX3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdca8Q8BHX3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdca8Q8BHX3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdca8Q8BHX3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdca8Q8BHX3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdca8Q8BHX3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdca8Q8BHX3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdca8Q8BHX3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdca8Q8BHX3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdca8Q8BHX3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdca8Q8BHX3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdca8Q8BHX3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdca8Q8BHX3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdca8Q8BHX3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdca8Q8BHX3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdca8Q8BHX3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdca8Q8BHX3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdca8Q8BHX3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdca8Q8BHX3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdca8Q8BHX3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdca8Q8BHX3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdca8Q8BHX3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdca8Q8BHX3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdca8Q8BHX3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdca8Q8BHX3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdca8Q8BHX3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdca8Q8BHX3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdca8Q8BHX3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdca8Q8BHX3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdca8Q8BHX3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdca8Q8BHX3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdca8Q8BHX3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdca8Q8BHX3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdca8Q8BHX3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdca8Q8BHX3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdca8Q8BHX3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdca8Q8BHX3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdca8Q8BHX3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdca8Q8BHX3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdca8Q8BHX3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdca8Q8BHX3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdca8Q8BHX3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdca8Q8BHX3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdca8Q8BHX3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdca8Q8BHX3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdca8Q8BHX3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
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