Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q8BGC1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q8BGC1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q8BGC1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q8BGC1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q8BGC1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q8BGC1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q8BGC1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q8BGC1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q8BGC1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q8BGC1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Q8BGC1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q8BGC1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q8BGC1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q8BGC1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q8BGC1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q8BGC1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Q8BGC1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Q8BGC1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q8BGC1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Q8BGC1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q8BGC1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q8BGC1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q8BGC1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q8BGC1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q8BGC1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q8BGC1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q8BGC1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q8BGC1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Q8BGC1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Q8BGC1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q8BGC1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Q8BGC1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q8BGC1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q8BGC1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q8BGC1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Q8BGC1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q8BGC1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q8BGC1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q8BGC1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q8BGC1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q8BGC1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q8BGC1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q8BGC1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q8BGC1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q8BGC1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q8BGC1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q8BGC1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q8BGC1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q8BGC1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q8BGC1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q8BGC1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q8BGC1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q8BGC1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q8BGC1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Q8BGC1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q8BGC1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q8BGC1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q8BGC1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q8BGC1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q8BGC1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q8BGC1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Q8BGC1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Q8BGC1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q8BGC1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q8BGC1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q8BGC1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q8BGC1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q8BGC1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q8BGC1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q8BGC1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q8BGC1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Q8BGC1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q8BGC1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q8BGC1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Q8BGC1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q8BGC1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q8BGC1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q8BGC1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q8BGC1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Q8BGC1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q8BGC1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q8BGC1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q8BGC1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q8BGC1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q8BGC1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q8BGC1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Q8BGC1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Q8BGC1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q8BGC1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q8BGC1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q8BGC1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q8BGC1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q8BGC1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Q8BGC1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q8BGC1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q8BGC1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Q8BGC1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Q8BGC1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Q8BGC1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
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