Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrrtm2Q8BGA3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lrrtm2Q8BGA3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lrrtm2Q8BGA3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lrrtm2Q8BGA3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lrrtm2Q8BGA3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lrrtm2Q8BGA3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lrrtm2Q8BGA3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lrrtm2Q8BGA3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lrrtm2Q8BGA3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lrrtm2Q8BGA3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lrrtm2Q8BGA3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Lrrtm2Q8BGA3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lrrtm2Q8BGA3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Lrrtm2Q8BGA3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Lrrtm2Q8BGA3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lrrtm2Q8BGA3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Lrrtm2Q8BGA3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lrrtm2Q8BGA3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lrrtm2Q8BGA3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lrrtm2Q8BGA3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Lrrtm2Q8BGA3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lrrtm2Q8BGA3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lrrtm2Q8BGA3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lrrtm2Q8BGA3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lrrtm2Q8BGA3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lrrtm2Q8BGA3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lrrtm2Q8BGA3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lrrtm2Q8BGA3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lrrtm2Q8BGA3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lrrtm2Q8BGA3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lrrtm2Q8BGA3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lrrtm2Q8BGA3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lrrtm2Q8BGA3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lrrtm2Q8BGA3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lrrtm2Q8BGA3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Lrrtm2Q8BGA3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lrrtm2Q8BGA3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lrrtm2Q8BGA3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Lrrtm2Q8BGA3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lrrtm2Q8BGA3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lrrtm2Q8BGA3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lrrtm2Q8BGA3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lrrtm2Q8BGA3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Lrrtm2Q8BGA3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lrrtm2Q8BGA3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lrrtm2Q8BGA3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lrrtm2Q8BGA3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lrrtm2Q8BGA3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lrrtm2Q8BGA3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrrtm2Q8BGA3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrrtm2Q8BGA3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrrtm2Q8BGA3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrrtm2Q8BGA3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrrtm2Q8BGA3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrrtm2Q8BGA3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrrtm2Q8BGA3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrrtm2Q8BGA3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrrtm2Q8BGA3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrrtm2Q8BGA3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrrtm2Q8BGA3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrtm2Q8BGA3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrtm2Q8BGA3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrtm2Q8BGA3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrtm2Q8BGA3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrtm2Q8BGA3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrtm2Q8BGA3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrtm2Q8BGA3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrtm2Q8BGA3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrtm2Q8BGA3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrtm2Q8BGA3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrtm2Q8BGA3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrtm2Q8BGA3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrtm2Q8BGA3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrtm2Q8BGA3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrtm2Q8BGA3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrtm2Q8BGA3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lrrtm2Q8BGA3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lrrtm2Q8BGA3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrtm2Q8BGA3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrtm2Q8BGA3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrtm2Q8BGA3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrtm2Q8BGA3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrtm2Q8BGA3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrtm2Q8BGA3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrtm2Q8BGA3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrtm2Q8BGA3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
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