Protein–RNA interactions for Protein: Q812A2

Srgap3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srgap3Q812A2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Srgap3Q812A2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Srgap3Q812A2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Srgap3Q812A2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Srgap3Q812A2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Srgap3Q812A2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Srgap3Q812A2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Srgap3Q812A2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Srgap3Q812A2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Srgap3Q812A2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Srgap3Q812A2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Srgap3Q812A2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Srgap3Q812A2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Srgap3Q812A2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Srgap3Q812A2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Srgap3Q812A2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Srgap3Q812A2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Srgap3Q812A2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Srgap3Q812A2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Srgap3Q812A2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Srgap3Q812A2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Srgap3Q812A2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Srgap3Q812A2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Srgap3Q812A2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Srgap3Q812A2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Srgap3Q812A2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Srgap3Q812A2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Srgap3Q812A2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Srgap3Q812A2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Srgap3Q812A2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Srgap3Q812A2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Srgap3Q812A2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Srgap3Q812A2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Srgap3Q812A2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Srgap3Q812A2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Srgap3Q812A2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Srgap3Q812A2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Srgap3Q812A2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Srgap3Q812A2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Srgap3Q812A2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Srgap3Q812A2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Srgap3Q812A2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Srgap3Q812A2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Srgap3Q812A2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Srgap3Q812A2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Srgap3Q812A2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Srgap3Q812A2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Srgap3Q812A2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Srgap3Q812A2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Srgap3Q812A2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Srgap3Q812A2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Srgap3Q812A2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Srgap3Q812A2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Srgap3Q812A2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Srgap3Q812A2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Srgap3Q812A2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Srgap3Q812A2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Srgap3Q812A2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Srgap3Q812A2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Srgap3Q812A2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Srgap3Q812A2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Srgap3Q812A2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Srgap3Q812A2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Srgap3Q812A2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Srgap3Q812A2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Srgap3Q812A2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Srgap3Q812A2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Srgap3Q812A2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Srgap3Q812A2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Srgap3Q812A2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Srgap3Q812A2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Srgap3Q812A2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Srgap3Q812A2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Srgap3Q812A2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Srgap3Q812A2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Srgap3Q812A2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Srgap3Q812A2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Srgap3Q812A2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Srgap3Q812A2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Srgap3Q812A2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Srgap3Q812A2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Srgap3Q812A2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Srgap3Q812A2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Srgap3Q812A2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Srgap3Q812A2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Srgap3Q812A2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Srgap3Q812A2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Srgap3Q812A2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Srgap3Q812A2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Srgap3Q812A2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Srgap3Q812A2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Srgap3Q812A2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Srgap3Q812A2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Srgap3Q812A2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Srgap3Q812A2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Srgap3Q812A2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Srgap3Q812A2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Srgap3Q812A2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Srgap3Q812A2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Srgap3Q812A2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms