Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SnupnQ80W37 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SnupnQ80W37 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SnupnQ80W37 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SnupnQ80W37 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SnupnQ80W37 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SnupnQ80W37 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SnupnQ80W37 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SnupnQ80W37 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SnupnQ80W37 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SnupnQ80W37 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SnupnQ80W37 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SnupnQ80W37 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SnupnQ80W37 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SnupnQ80W37 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SnupnQ80W37 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SnupnQ80W37 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SnupnQ80W37 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SnupnQ80W37 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SnupnQ80W37 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SnupnQ80W37 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SnupnQ80W37 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SnupnQ80W37 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SnupnQ80W37 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SnupnQ80W37 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SnupnQ80W37 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SnupnQ80W37 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SnupnQ80W37 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SnupnQ80W37 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SnupnQ80W37 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SnupnQ80W37 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SnupnQ80W37 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SnupnQ80W37 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SnupnQ80W37 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SnupnQ80W37 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SnupnQ80W37 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SnupnQ80W37 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SnupnQ80W37 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SnupnQ80W37 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SnupnQ80W37 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SnupnQ80W37 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SnupnQ80W37 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SnupnQ80W37 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SnupnQ80W37 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SnupnQ80W37 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SnupnQ80W37 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SnupnQ80W37 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SnupnQ80W37 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SnupnQ80W37 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SnupnQ80W37 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SnupnQ80W37 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SnupnQ80W37 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SnupnQ80W37 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SnupnQ80W37 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SnupnQ80W37 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SnupnQ80W37 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SnupnQ80W37 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SnupnQ80W37 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SnupnQ80W37 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SnupnQ80W37 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SnupnQ80W37 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SnupnQ80W37 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SnupnQ80W37 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SnupnQ80W37 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SnupnQ80W37 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SnupnQ80W37 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SnupnQ80W37 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SnupnQ80W37 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SnupnQ80W37 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SnupnQ80W37 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SnupnQ80W37 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SnupnQ80W37 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SnupnQ80W37 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SnupnQ80W37 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SnupnQ80W37 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SnupnQ80W37 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SnupnQ80W37 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SnupnQ80W37 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SnupnQ80W37 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SnupnQ80W37 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SnupnQ80W37 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SnupnQ80W37 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SnupnQ80W37 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SnupnQ80W37 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SnupnQ80W37 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SnupnQ80W37 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SnupnQ80W37 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SnupnQ80W37 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SnupnQ80W37 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SnupnQ80W37 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SnupnQ80W37 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SnupnQ80W37 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SnupnQ80W37 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SnupnQ80W37 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SnupnQ80W37 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SnupnQ80W37 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SnupnQ80W37 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SnupnQ80W37 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SnupnQ80W37 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SnupnQ80W37 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
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