Protein–RNA interactions for Protein: Q80U87

Usp8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,080 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp8Q80U87 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp8Q80U87 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp8Q80U87 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp8Q80U87 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp8Q80U87 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp8Q80U87 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp8Q80U87 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp8Q80U87 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp8Q80U87 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp8Q80U87 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp8Q80U87 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp8Q80U87 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp8Q80U87 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp8Q80U87 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp8Q80U87 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp8Q80U87 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp8Q80U87 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp8Q80U87 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp8Q80U87 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp8Q80U87 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp8Q80U87 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp8Q80U87 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp8Q80U87 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp8Q80U87 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp8Q80U87 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp8Q80U87 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp8Q80U87 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp8Q80U87 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp8Q80U87 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp8Q80U87 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp8Q80U87 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp8Q80U87 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp8Q80U87 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp8Q80U87 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp8Q80U87 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp8Q80U87 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp8Q80U87 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp8Q80U87 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp8Q80U87 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp8Q80U87 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp8Q80U87 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp8Q80U87 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp8Q80U87 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp8Q80U87 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp8Q80U87 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp8Q80U87 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp8Q80U87 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp8Q80U87 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp8Q80U87 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp8Q80U87 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp8Q80U87 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp8Q80U87 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp8Q80U87 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp8Q80U87 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp8Q80U87 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp8Q80U87 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp8Q80U87 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp8Q80U87 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp8Q80U87 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp8Q80U87 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp8Q80U87 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp8Q80U87 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp8Q80U87 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp8Q80U87 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp8Q80U87 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp8Q80U87 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp8Q80U87 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp8Q80U87 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp8Q80U87 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp8Q80U87 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp8Q80U87 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp8Q80U87 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp8Q80U87 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp8Q80U87 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp8Q80U87 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp8Q80U87 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp8Q80U87 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp8Q80U87 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp8Q80U87 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp8Q80U87 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp8Q80U87 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp8Q80U87 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp8Q80U87 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp8Q80U87 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp8Q80U87 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp8Q80U87 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Usp8Q80U87 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Usp8Q80U87 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Usp8Q80U87 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Usp8Q80U87 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp8Q80U87 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp8Q80U87 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp8Q80U87 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp8Q80U87 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp8Q80U87 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp8Q80U87 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp8Q80U87 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp8Q80U87 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp8Q80U87 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp8Q80U87 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 389 ms