Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT18

Atf7ip, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf7ipQ7TT18 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Atf7ipQ7TT18 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Atf7ipQ7TT18 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Atf7ipQ7TT18 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Atf7ipQ7TT18 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Atf7ipQ7TT18 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Atf7ipQ7TT18 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Atf7ipQ7TT18 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Atf7ipQ7TT18 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Atf7ipQ7TT18 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Atf7ipQ7TT18 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Atf7ipQ7TT18 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Atf7ipQ7TT18 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Atf7ipQ7TT18 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Atf7ipQ7TT18 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Atf7ipQ7TT18 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Atf7ipQ7TT18 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Atf7ipQ7TT18 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Atf7ipQ7TT18 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Atf7ipQ7TT18 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Atf7ipQ7TT18 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Atf7ipQ7TT18 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Atf7ipQ7TT18 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Atf7ipQ7TT18 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Atf7ipQ7TT18 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Atf7ipQ7TT18 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Atf7ipQ7TT18 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Atf7ipQ7TT18 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Atf7ipQ7TT18 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Atf7ipQ7TT18 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Atf7ipQ7TT18 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Atf7ipQ7TT18 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Atf7ipQ7TT18 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Atf7ipQ7TT18 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Atf7ipQ7TT18 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Atf7ipQ7TT18 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Atf7ipQ7TT18 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Atf7ipQ7TT18 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Atf7ipQ7TT18 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Atf7ipQ7TT18 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Atf7ipQ7TT18 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Atf7ipQ7TT18 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Atf7ipQ7TT18 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Atf7ipQ7TT18 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Atf7ipQ7TT18 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Atf7ipQ7TT18 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Atf7ipQ7TT18 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Atf7ipQ7TT18 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Atf7ipQ7TT18 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Atf7ipQ7TT18 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Atf7ipQ7TT18 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Atf7ipQ7TT18 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Atf7ipQ7TT18 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Atf7ipQ7TT18 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Atf7ipQ7TT18 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Atf7ipQ7TT18 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Atf7ipQ7TT18 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Atf7ipQ7TT18 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Atf7ipQ7TT18 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Atf7ipQ7TT18 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Atf7ipQ7TT18 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Atf7ipQ7TT18 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Atf7ipQ7TT18 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Atf7ipQ7TT18 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Atf7ipQ7TT18 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Atf7ipQ7TT18 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Atf7ipQ7TT18 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Atf7ipQ7TT18 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Atf7ipQ7TT18 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Atf7ipQ7TT18 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Atf7ipQ7TT18 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Atf7ipQ7TT18 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Atf7ipQ7TT18 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Atf7ipQ7TT18 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Atf7ipQ7TT18 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Atf7ipQ7TT18 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Atf7ipQ7TT18 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Atf7ipQ7TT18 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Atf7ipQ7TT18 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Atf7ipQ7TT18 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Atf7ipQ7TT18 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Atf7ipQ7TT18 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Atf7ipQ7TT18 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Atf7ipQ7TT18 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Atf7ipQ7TT18 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Atf7ipQ7TT18 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Atf7ipQ7TT18 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Atf7ipQ7TT18 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Atf7ipQ7TT18 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Atf7ipQ7TT18 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Atf7ipQ7TT18 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Atf7ipQ7TT18 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Atf7ipQ7TT18 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Atf7ipQ7TT18 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Atf7ipQ7TT18 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Atf7ipQ7TT18 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Atf7ipQ7TT18 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Atf7ipQ7TT18 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Atf7ipQ7TT18 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Atf7ipQ7TT18 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms